Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec22cQ8BXT9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec22cQ8BXT9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec22cQ8BXT9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sec22cQ8BXT9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec22cQ8BXT9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec22cQ8BXT9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec22cQ8BXT9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec22cQ8BXT9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec22cQ8BXT9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec22cQ8BXT9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec22cQ8BXT9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec22cQ8BXT9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec22cQ8BXT9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec22cQ8BXT9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec22cQ8BXT9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec22cQ8BXT9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec22cQ8BXT9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec22cQ8BXT9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec22cQ8BXT9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec22cQ8BXT9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec22cQ8BXT9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec22cQ8BXT9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec22cQ8BXT9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec22cQ8BXT9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec22cQ8BXT9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec22cQ8BXT9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec22cQ8BXT9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec22cQ8BXT9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec22cQ8BXT9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec22cQ8BXT9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec22cQ8BXT9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec22cQ8BXT9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sec22cQ8BXT9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sec22cQ8BXT9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec22cQ8BXT9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec22cQ8BXT9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec22cQ8BXT9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec22cQ8BXT9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec22cQ8BXT9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec22cQ8BXT9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec22cQ8BXT9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec22cQ8BXT9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec22cQ8BXT9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec22cQ8BXT9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec22cQ8BXT9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec22cQ8BXT9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec22cQ8BXT9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec22cQ8BXT9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec22cQ8BXT9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec22cQ8BXT9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec22cQ8BXT9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec22cQ8BXT9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec22cQ8BXT9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec22cQ8BXT9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec22cQ8BXT9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec22cQ8BXT9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec22cQ8BXT9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec22cQ8BXT9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec22cQ8BXT9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec22cQ8BXT9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec22cQ8BXT9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec22cQ8BXT9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec22cQ8BXT9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec22cQ8BXT9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec22cQ8BXT9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec22cQ8BXT9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec22cQ8BXT9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec22cQ8BXT9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec22cQ8BXT9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec22cQ8BXT9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec22cQ8BXT9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec22cQ8BXT9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec22cQ8BXT9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec22cQ8BXT9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec22cQ8BXT9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sec22cQ8BXT9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sec22cQ8BXT9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sec22cQ8BXT9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms