Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdsp2Q8BX07 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctdsp2Q8BX07 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdsp2Q8BX07 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdsp2Q8BX07 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdsp2Q8BX07 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdsp2Q8BX07 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdsp2Q8BX07 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdsp2Q8BX07 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdsp2Q8BX07 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdsp2Q8BX07 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdsp2Q8BX07 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdsp2Q8BX07 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdsp2Q8BX07 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdsp2Q8BX07 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdsp2Q8BX07 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdsp2Q8BX07 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdsp2Q8BX07 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdsp2Q8BX07 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctdsp2Q8BX07 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctdsp2Q8BX07 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdsp2Q8BX07 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdsp2Q8BX07 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctdsp2Q8BX07 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctdsp2Q8BX07 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctdsp2Q8BX07 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctdsp2Q8BX07 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdsp2Q8BX07 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctdsp2Q8BX07 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp2Q8BX07 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp2Q8BX07 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp2Q8BX07 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp2Q8BX07 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp2Q8BX07 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctdsp2Q8BX07 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp2Q8BX07 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctdsp2Q8BX07 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp2Q8BX07 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctdsp2Q8BX07 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdsp2Q8BX07 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctdsp2Q8BX07 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp2Q8BX07 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp2Q8BX07 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctdsp2Q8BX07 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdsp2Q8BX07 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdsp2Q8BX07 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdsp2Q8BX07 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdsp2Q8BX07 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdsp2Q8BX07 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdsp2Q8BX07 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdsp2Q8BX07 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdsp2Q8BX07 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdsp2Q8BX07 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdsp2Q8BX07 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdsp2Q8BX07 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdsp2Q8BX07 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdsp2Q8BX07 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdsp2Q8BX07 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdsp2Q8BX07 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdsp2Q8BX07 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdsp2Q8BX07 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdsp2Q8BX07 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdsp2Q8BX07 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdsp2Q8BX07 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdsp2Q8BX07 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdsp2Q8BX07 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdsp2Q8BX07 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdsp2Q8BX07 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdsp2Q8BX07 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdsp2Q8BX07 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdsp2Q8BX07 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdsp2Q8BX07 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdsp2Q8BX07 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdsp2Q8BX07 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdsp2Q8BX07 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdsp2Q8BX07 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdsp2Q8BX07 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdsp2Q8BX07 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdsp2Q8BX07 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdsp2Q8BX07 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdsp2Q8BX07 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdsp2Q8BX07 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdsp2Q8BX07 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdsp2Q8BX07 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdsp2Q8BX07 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdsp2Q8BX07 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdsp2Q8BX07 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdsp2Q8BX07 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdsp2Q8BX07 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdsp2Q8BX07 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdsp2Q8BX07 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdsp2Q8BX07 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdsp2Q8BX07 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdsp2Q8BX07 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdsp2Q8BX07 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdsp2Q8BX07 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms