Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTV2

Cpsf7, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf7Q8BTV2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cpsf7Q8BTV2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpsf7Q8BTV2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpsf7Q8BTV2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpsf7Q8BTV2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpsf7Q8BTV2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpsf7Q8BTV2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cpsf7Q8BTV2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cpsf7Q8BTV2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpsf7Q8BTV2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpsf7Q8BTV2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpsf7Q8BTV2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpsf7Q8BTV2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpsf7Q8BTV2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpsf7Q8BTV2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpsf7Q8BTV2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpsf7Q8BTV2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf7Q8BTV2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpsf7Q8BTV2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpsf7Q8BTV2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf7Q8BTV2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf7Q8BTV2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpsf7Q8BTV2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpsf7Q8BTV2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf7Q8BTV2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf7Q8BTV2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf7Q8BTV2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpsf7Q8BTV2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpsf7Q8BTV2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpsf7Q8BTV2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpsf7Q8BTV2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpsf7Q8BTV2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpsf7Q8BTV2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpsf7Q8BTV2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpsf7Q8BTV2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpsf7Q8BTV2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpsf7Q8BTV2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpsf7Q8BTV2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpsf7Q8BTV2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpsf7Q8BTV2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpsf7Q8BTV2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpsf7Q8BTV2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf7Q8BTV2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf7Q8BTV2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf7Q8BTV2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf7Q8BTV2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf7Q8BTV2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf7Q8BTV2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf7Q8BTV2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf7Q8BTV2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf7Q8BTV2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf7Q8BTV2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf7Q8BTV2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf7Q8BTV2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf7Q8BTV2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpsf7Q8BTV2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpsf7Q8BTV2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf7Q8BTV2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpsf7Q8BTV2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf7Q8BTV2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf7Q8BTV2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf7Q8BTV2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf7Q8BTV2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpsf7Q8BTV2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf7Q8BTV2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf7Q8BTV2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf7Q8BTV2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf7Q8BTV2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpsf7Q8BTV2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf7Q8BTV2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpsf7Q8BTV2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpsf7Q8BTV2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf7Q8BTV2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cpsf7Q8BTV2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpsf7Q8BTV2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpsf7Q8BTV2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpsf7Q8BTV2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpsf7Q8BTV2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms