Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Pbrm1Q8BSQ9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Pbrm1Q8BSQ9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Pbrm1Q8BSQ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Pbrm1Q8BSQ9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Pbrm1Q8BSQ9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Pbrm1Q8BSQ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Pbrm1Q8BSQ9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Pbrm1Q8BSQ9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Pbrm1Q8BSQ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Pbrm1Q8BSQ9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Pbrm1Q8BSQ9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Pbrm1Q8BSQ9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Pbrm1Q8BSQ9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Pbrm1Q8BSQ9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Pbrm1Q8BSQ9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Pbrm1Q8BSQ9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Pbrm1Q8BSQ9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
Pbrm1Q8BSQ9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC40.02■■■■■ 4
Pbrm1Q8BSQ9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Pbrm1Q8BSQ9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Pbrm1Q8BSQ9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
Pbrm1Q8BSQ9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
Pbrm1Q8BSQ9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC40■■■■□ 3.99
Pbrm1Q8BSQ9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Pbrm1Q8BSQ9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Pbrm1Q8BSQ9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Pbrm1Q8BSQ9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Pbrm1Q8BSQ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Pbrm1Q8BSQ9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
Pbrm1Q8BSQ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Pbrm1Q8BSQ9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.99
Pbrm1Q8BSQ9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Pbrm1Q8BSQ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Pbrm1Q8BSQ9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Pbrm1Q8BSQ9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Pbrm1Q8BSQ9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Pbrm1Q8BSQ9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Pbrm1Q8BSQ9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Pbrm1Q8BSQ9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Pbrm1Q8BSQ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Pbrm1Q8BSQ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Pbrm1Q8BSQ9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Pbrm1Q8BSQ9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Pbrm1Q8BSQ9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Pbrm1Q8BSQ9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Pbrm1Q8BSQ9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Pbrm1Q8BSQ9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Pbrm1Q8BSQ9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Pbrm1Q8BSQ9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Pbrm1Q8BSQ9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Pbrm1Q8BSQ9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Pbrm1Q8BSQ9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Pbrm1Q8BSQ9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Pbrm1Q8BSQ9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Pbrm1Q8BSQ9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Pbrm1Q8BSQ9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Pbrm1Q8BSQ9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Pbrm1Q8BSQ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Pbrm1Q8BSQ9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
Pbrm1Q8BSQ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Pbrm1Q8BSQ9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Pbrm1Q8BSQ9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Pbrm1Q8BSQ9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Pbrm1Q8BSQ9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Pbrm1Q8BSQ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Pbrm1Q8BSQ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Pbrm1Q8BSQ9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Pbrm1Q8BSQ9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Pbrm1Q8BSQ9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Pbrm1Q8BSQ9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Pbrm1Q8BSQ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Pbrm1Q8BSQ9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
Pbrm1Q8BSQ9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Pbrm1Q8BSQ9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Pbrm1Q8BSQ9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Pbrm1Q8BSQ9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Pbrm1Q8BSQ9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Pbrm1Q8BSQ9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Pbrm1Q8BSQ9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Pbrm1Q8BSQ9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Pbrm1Q8BSQ9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Pbrm1Q8BSQ9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Pbrm1Q8BSQ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
Pbrm1Q8BSQ9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Pbrm1Q8BSQ9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Pbrm1Q8BSQ9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Pbrm1Q8BSQ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Pbrm1Q8BSQ9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Pbrm1Q8BSQ9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms