Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf18Q8BM39 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf18Q8BM39 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf18Q8BM39 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf18Q8BM39 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf18Q8BM39 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf18Q8BM39 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf18Q8BM39 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf18Q8BM39 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf18Q8BM39 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf18Q8BM39 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf18Q8BM39 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf18Q8BM39 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf18Q8BM39 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf18Q8BM39 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf18Q8BM39 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf18Q8BM39 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf18Q8BM39 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf18Q8BM39 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf18Q8BM39 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf18Q8BM39 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf18Q8BM39 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf18Q8BM39 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf18Q8BM39 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf18Q8BM39 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf18Q8BM39 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf18Q8BM39 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf18Q8BM39 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf18Q8BM39 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf18Q8BM39 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prpf18Q8BM39 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prpf18Q8BM39 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf18Q8BM39 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf18Q8BM39 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf18Q8BM39 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf18Q8BM39 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf18Q8BM39 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf18Q8BM39 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf18Q8BM39 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf18Q8BM39 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf18Q8BM39 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf18Q8BM39 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf18Q8BM39 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf18Q8BM39 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf18Q8BM39 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf18Q8BM39 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf18Q8BM39 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf18Q8BM39 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf18Q8BM39 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf18Q8BM39 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prpf18Q8BM39 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf18Q8BM39 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf18Q8BM39 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf18Q8BM39 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf18Q8BM39 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf18Q8BM39 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf18Q8BM39 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf18Q8BM39 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf18Q8BM39 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf18Q8BM39 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf18Q8BM39 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf18Q8BM39 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf18Q8BM39 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf18Q8BM39 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf18Q8BM39 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf18Q8BM39 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf18Q8BM39 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf18Q8BM39 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf18Q8BM39 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf18Q8BM39 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf18Q8BM39 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf18Q8BM39 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf18Q8BM39 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf18Q8BM39 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf18Q8BM39 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf18Q8BM39 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf18Q8BM39 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf18Q8BM39 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf18Q8BM39 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms