Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLA8

Trpa1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpa1Q8BLA8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpa1Q8BLA8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpa1Q8BLA8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpa1Q8BLA8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpa1Q8BLA8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpa1Q8BLA8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpa1Q8BLA8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpa1Q8BLA8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpa1Q8BLA8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpa1Q8BLA8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpa1Q8BLA8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpa1Q8BLA8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpa1Q8BLA8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpa1Q8BLA8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpa1Q8BLA8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpa1Q8BLA8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpa1Q8BLA8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpa1Q8BLA8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpa1Q8BLA8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpa1Q8BLA8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpa1Q8BLA8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpa1Q8BLA8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpa1Q8BLA8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpa1Q8BLA8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpa1Q8BLA8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpa1Q8BLA8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpa1Q8BLA8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpa1Q8BLA8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpa1Q8BLA8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpa1Q8BLA8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpa1Q8BLA8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpa1Q8BLA8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpa1Q8BLA8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpa1Q8BLA8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpa1Q8BLA8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpa1Q8BLA8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpa1Q8BLA8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpa1Q8BLA8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpa1Q8BLA8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpa1Q8BLA8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpa1Q8BLA8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpa1Q8BLA8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpa1Q8BLA8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpa1Q8BLA8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpa1Q8BLA8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpa1Q8BLA8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpa1Q8BLA8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpa1Q8BLA8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpa1Q8BLA8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpa1Q8BLA8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpa1Q8BLA8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpa1Q8BLA8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpa1Q8BLA8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpa1Q8BLA8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpa1Q8BLA8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpa1Q8BLA8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpa1Q8BLA8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpa1Q8BLA8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpa1Q8BLA8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpa1Q8BLA8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpa1Q8BLA8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpa1Q8BLA8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpa1Q8BLA8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpa1Q8BLA8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpa1Q8BLA8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpa1Q8BLA8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpa1Q8BLA8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpa1Q8BLA8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpa1Q8BLA8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpa1Q8BLA8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpa1Q8BLA8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpa1Q8BLA8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpa1Q8BLA8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpa1Q8BLA8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trpa1Q8BLA8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trpa1Q8BLA8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpa1Q8BLA8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpa1Q8BLA8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpa1Q8BLA8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms