Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHK2

Scn3b, Sodium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3bQ8BHK2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn3bQ8BHK2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn3bQ8BHK2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn3bQ8BHK2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn3bQ8BHK2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn3bQ8BHK2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn3bQ8BHK2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn3bQ8BHK2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn3bQ8BHK2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn3bQ8BHK2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn3bQ8BHK2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn3bQ8BHK2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn3bQ8BHK2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn3bQ8BHK2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn3bQ8BHK2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn3bQ8BHK2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn3bQ8BHK2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn3bQ8BHK2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn3bQ8BHK2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn3bQ8BHK2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn3bQ8BHK2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn3bQ8BHK2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn3bQ8BHK2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn3bQ8BHK2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn3bQ8BHK2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn3bQ8BHK2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn3bQ8BHK2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn3bQ8BHK2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn3bQ8BHK2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn3bQ8BHK2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn3bQ8BHK2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn3bQ8BHK2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn3bQ8BHK2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn3bQ8BHK2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn3bQ8BHK2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn3bQ8BHK2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn3bQ8BHK2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn3bQ8BHK2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn3bQ8BHK2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn3bQ8BHK2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn3bQ8BHK2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn3bQ8BHK2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn3bQ8BHK2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn3bQ8BHK2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn3bQ8BHK2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn3bQ8BHK2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn3bQ8BHK2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn3bQ8BHK2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn3bQ8BHK2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn3bQ8BHK2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn3bQ8BHK2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn3bQ8BHK2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn3bQ8BHK2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn3bQ8BHK2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn3bQ8BHK2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn3bQ8BHK2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn3bQ8BHK2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scn3bQ8BHK2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn3bQ8BHK2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn3bQ8BHK2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn3bQ8BHK2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn3bQ8BHK2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn3bQ8BHK2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn3bQ8BHK2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn3bQ8BHK2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn3bQ8BHK2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn3bQ8BHK2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn3bQ8BHK2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn3bQ8BHK2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn3bQ8BHK2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn3bQ8BHK2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn3bQ8BHK2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn3bQ8BHK2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms