Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD5

Cpt1c, Carnitine O-palmitoyltransferase 1, brain isoform, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpt1cQ8BGD5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpt1cQ8BGD5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpt1cQ8BGD5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpt1cQ8BGD5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpt1cQ8BGD5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpt1cQ8BGD5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpt1cQ8BGD5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpt1cQ8BGD5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpt1cQ8BGD5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cpt1cQ8BGD5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpt1cQ8BGD5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpt1cQ8BGD5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpt1cQ8BGD5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpt1cQ8BGD5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpt1cQ8BGD5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpt1cQ8BGD5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpt1cQ8BGD5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpt1cQ8BGD5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpt1cQ8BGD5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpt1cQ8BGD5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpt1cQ8BGD5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpt1cQ8BGD5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpt1cQ8BGD5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpt1cQ8BGD5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpt1cQ8BGD5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpt1cQ8BGD5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpt1cQ8BGD5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpt1cQ8BGD5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpt1cQ8BGD5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpt1cQ8BGD5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpt1cQ8BGD5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpt1cQ8BGD5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpt1cQ8BGD5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpt1cQ8BGD5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpt1cQ8BGD5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpt1cQ8BGD5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpt1cQ8BGD5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpt1cQ8BGD5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpt1cQ8BGD5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpt1cQ8BGD5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpt1cQ8BGD5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpt1cQ8BGD5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpt1cQ8BGD5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpt1cQ8BGD5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpt1cQ8BGD5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpt1cQ8BGD5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpt1cQ8BGD5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpt1cQ8BGD5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpt1cQ8BGD5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpt1cQ8BGD5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpt1cQ8BGD5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpt1cQ8BGD5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpt1cQ8BGD5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpt1cQ8BGD5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpt1cQ8BGD5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpt1cQ8BGD5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpt1cQ8BGD5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpt1cQ8BGD5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpt1cQ8BGD5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpt1cQ8BGD5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpt1cQ8BGD5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpt1cQ8BGD5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpt1cQ8BGD5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpt1cQ8BGD5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpt1cQ8BGD5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpt1cQ8BGD5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpt1cQ8BGD5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpt1cQ8BGD5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpt1cQ8BGD5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpt1cQ8BGD5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpt1cQ8BGD5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpt1cQ8BGD5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpt1cQ8BGD5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpt1cQ8BGD5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpt1cQ8BGD5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpt1cQ8BGD5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpt1cQ8BGD5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpt1cQ8BGD5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpt1cQ8BGD5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpt1cQ8BGD5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms