Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc50Q810U5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc50Q810U5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc50Q810U5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc50Q810U5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc50Q810U5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc50Q810U5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc50Q810U5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc50Q810U5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc50Q810U5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc50Q810U5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc50Q810U5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc50Q810U5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc50Q810U5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc50Q810U5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc50Q810U5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc50Q810U5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc50Q810U5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc50Q810U5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc50Q810U5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc50Q810U5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc50Q810U5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc50Q810U5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc50Q810U5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc50Q810U5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc50Q810U5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc50Q810U5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc50Q810U5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc50Q810U5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc50Q810U5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc50Q810U5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc50Q810U5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc50Q810U5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc50Q810U5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc50Q810U5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc50Q810U5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc50Q810U5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc50Q810U5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc50Q810U5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc50Q810U5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc50Q810U5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc50Q810U5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc50Q810U5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc50Q810U5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc50Q810U5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc50Q810U5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc50Q810U5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc50Q810U5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc50Q810U5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc50Q810U5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc50Q810U5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc50Q810U5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc50Q810U5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc50Q810U5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc50Q810U5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc50Q810U5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc50Q810U5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc50Q810U5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc50Q810U5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc50Q810U5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc50Q810U5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc50Q810U5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc50Q810U5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc50Q810U5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc50Q810U5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc50Q810U5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc50Q810U5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc50Q810U5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc50Q810U5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc50Q810U5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc50Q810U5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc50Q810U5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc50Q810U5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc50Q810U5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc50Q810U5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc50Q810U5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc50Q810U5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc50Q810U5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms