Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn34b3Q80ZS5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn34b3Q80ZS5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn34b3Q80ZS5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn34b3Q80ZS5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn34b3Q80ZS5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn34b3Q80ZS5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn34b3Q80ZS5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn34b3Q80ZS5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn34b3Q80ZS5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cldn34b3Q80ZS5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn34b3Q80ZS5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn34b3Q80ZS5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn34b3Q80ZS5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn34b3Q80ZS5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn34b3Q80ZS5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn34b3Q80ZS5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn34b3Q80ZS5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn34b3Q80ZS5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn34b3Q80ZS5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn34b3Q80ZS5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn34b3Q80ZS5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn34b3Q80ZS5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn34b3Q80ZS5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn34b3Q80ZS5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn34b3Q80ZS5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn34b3Q80ZS5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn34b3Q80ZS5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn34b3Q80ZS5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn34b3Q80ZS5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn34b3Q80ZS5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn34b3Q80ZS5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn34b3Q80ZS5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn34b3Q80ZS5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn34b3Q80ZS5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn34b3Q80ZS5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn34b3Q80ZS5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn34b3Q80ZS5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn34b3Q80ZS5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn34b3Q80ZS5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn34b3Q80ZS5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn34b3Q80ZS5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn34b3Q80ZS5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn34b3Q80ZS5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn34b3Q80ZS5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn34b3Q80ZS5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn34b3Q80ZS5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn34b3Q80ZS5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn34b3Q80ZS5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn34b3Q80ZS5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn34b3Q80ZS5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn34b3Q80ZS5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn34b3Q80ZS5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn34b3Q80ZS5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn34b3Q80ZS5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn34b3Q80ZS5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn34b3Q80ZS5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn34b3Q80ZS5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn34b3Q80ZS5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn34b3Q80ZS5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn34b3Q80ZS5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn34b3Q80ZS5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn34b3Q80ZS5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn34b3Q80ZS5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn34b3Q80ZS5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn34b3Q80ZS5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn34b3Q80ZS5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn34b3Q80ZS5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn34b3Q80ZS5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn34b3Q80ZS5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn34b3Q80ZS5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn34b3Q80ZS5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn34b3Q80ZS5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn34b3Q80ZS5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn34b3Q80ZS5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn34b3Q80ZS5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn34b3Q80ZS5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn34b3Q80ZS5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cldn34b3Q80ZS5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn34b3Q80ZS5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn34b3Q80ZS5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn34b3Q80ZS5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn34b3Q80ZS5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn34b3Q80ZS5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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