Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NanogQ80Z64 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NanogQ80Z64 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NanogQ80Z64 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NanogQ80Z64 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NanogQ80Z64 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NanogQ80Z64 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NanogQ80Z64 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NanogQ80Z64 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NanogQ80Z64 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NanogQ80Z64 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NanogQ80Z64 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NanogQ80Z64 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NanogQ80Z64 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NanogQ80Z64 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NanogQ80Z64 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NanogQ80Z64 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NanogQ80Z64 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NanogQ80Z64 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NanogQ80Z64 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NanogQ80Z64 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NanogQ80Z64 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NanogQ80Z64 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NanogQ80Z64 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NanogQ80Z64 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NanogQ80Z64 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NanogQ80Z64 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NanogQ80Z64 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NanogQ80Z64 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NanogQ80Z64 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NanogQ80Z64 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NanogQ80Z64 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NanogQ80Z64 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NanogQ80Z64 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NanogQ80Z64 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NanogQ80Z64 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NanogQ80Z64 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NanogQ80Z64 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NanogQ80Z64 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NanogQ80Z64 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NanogQ80Z64 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NanogQ80Z64 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NanogQ80Z64 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NanogQ80Z64 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NanogQ80Z64 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NanogQ80Z64 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NanogQ80Z64 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NanogQ80Z64 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NanogQ80Z64 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NanogQ80Z64 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NanogQ80Z64 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NanogQ80Z64 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NanogQ80Z64 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NanogQ80Z64 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NanogQ80Z64 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NanogQ80Z64 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NanogQ80Z64 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NanogQ80Z64 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NanogQ80Z64 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NanogQ80Z64 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NanogQ80Z64 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NanogQ80Z64 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NanogQ80Z64 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NanogQ80Z64 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NanogQ80Z64 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NanogQ80Z64 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NanogQ80Z64 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NanogQ80Z64 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NanogQ80Z64 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NanogQ80Z64 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NanogQ80Z64 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NanogQ80Z64 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NanogQ80Z64 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NanogQ80Z64 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NanogQ80Z64 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NanogQ80Z64 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NanogQ80Z64 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NanogQ80Z64 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NanogQ80Z64 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NanogQ80Z64 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NanogQ80Z64 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NanogQ80Z64 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NanogQ80Z64 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NanogQ80Z64 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NanogQ80Z64 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NanogQ80Z64 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NanogQ80Z64 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NanogQ80Z64 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NanogQ80Z64 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NanogQ80Z64 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NanogQ80Z64 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NanogQ80Z64 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NanogQ80Z64 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NanogQ80Z64 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NanogQ80Z64 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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