Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc27Q80YS5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc27Q80YS5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc27Q80YS5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc27Q80YS5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc27Q80YS5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc27Q80YS5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc27Q80YS5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc27Q80YS5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc27Q80YS5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc27Q80YS5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc27Q80YS5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc27Q80YS5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc27Q80YS5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc27Q80YS5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc27Q80YS5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc27Q80YS5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc27Q80YS5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc27Q80YS5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc27Q80YS5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc27Q80YS5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc27Q80YS5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc27Q80YS5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc27Q80YS5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc27Q80YS5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc27Q80YS5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc27Q80YS5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc27Q80YS5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc27Q80YS5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc27Q80YS5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc27Q80YS5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc27Q80YS5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc27Q80YS5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc27Q80YS5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc27Q80YS5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc27Q80YS5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc27Q80YS5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc27Q80YS5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc27Q80YS5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc27Q80YS5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc27Q80YS5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc27Q80YS5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc27Q80YS5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrc27Q80YS5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc27Q80YS5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc27Q80YS5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc27Q80YS5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc27Q80YS5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc27Q80YS5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc27Q80YS5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc27Q80YS5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc27Q80YS5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc27Q80YS5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc27Q80YS5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc27Q80YS5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc27Q80YS5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc27Q80YS5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc27Q80YS5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc27Q80YS5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc27Q80YS5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc27Q80YS5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc27Q80YS5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc27Q80YS5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc27Q80YS5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc27Q80YS5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc27Q80YS5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc27Q80YS5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc27Q80YS5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc27Q80YS5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc27Q80YS5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc27Q80YS5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc27Q80YS5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc27Q80YS5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc27Q80YS5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc27Q80YS5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc27Q80YS5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc27Q80YS5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc27Q80YS5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc27Q80YS5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc27Q80YS5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc27Q80YS5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc27Q80YS5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc27Q80YS5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc27Q80YS5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc27Q80YS5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc27Q80YS5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc27Q80YS5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc27Q80YS5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc27Q80YS5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc27Q80YS5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc27Q80YS5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc27Q80YS5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc27Q80YS5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc27Q80YS5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc27Q80YS5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc27Q80YS5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc27Q80YS5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc27Q80YS5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc27Q80YS5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc27Q80YS5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms