Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thnsl2Q80W22 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thnsl2Q80W22 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thnsl2Q80W22 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Thnsl2Q80W22 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thnsl2Q80W22 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thnsl2Q80W22 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thnsl2Q80W22 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thnsl2Q80W22 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thnsl2Q80W22 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thnsl2Q80W22 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thnsl2Q80W22 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thnsl2Q80W22 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thnsl2Q80W22 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thnsl2Q80W22 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thnsl2Q80W22 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thnsl2Q80W22 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thnsl2Q80W22 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thnsl2Q80W22 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thnsl2Q80W22 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thnsl2Q80W22 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Thnsl2Q80W22 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thnsl2Q80W22 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thnsl2Q80W22 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thnsl2Q80W22 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thnsl2Q80W22 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thnsl2Q80W22 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thnsl2Q80W22 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thnsl2Q80W22 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Thnsl2Q80W22 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thnsl2Q80W22 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thnsl2Q80W22 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thnsl2Q80W22 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thnsl2Q80W22 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thnsl2Q80W22 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thnsl2Q80W22 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thnsl2Q80W22 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thnsl2Q80W22 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thnsl2Q80W22 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Thnsl2Q80W22 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Thnsl2Q80W22 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thnsl2Q80W22 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thnsl2Q80W22 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thnsl2Q80W22 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thnsl2Q80W22 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thnsl2Q80W22 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thnsl2Q80W22 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thnsl2Q80W22 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thnsl2Q80W22 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thnsl2Q80W22 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thnsl2Q80W22 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thnsl2Q80W22 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Thnsl2Q80W22 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thnsl2Q80W22 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thnsl2Q80W22 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thnsl2Q80W22 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thnsl2Q80W22 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thnsl2Q80W22 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thnsl2Q80W22 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thnsl2Q80W22 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thnsl2Q80W22 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thnsl2Q80W22 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thnsl2Q80W22 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thnsl2Q80W22 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thnsl2Q80W22 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Thnsl2Q80W22 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thnsl2Q80W22 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thnsl2Q80W22 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thnsl2Q80W22 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thnsl2Q80W22 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thnsl2Q80W22 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thnsl2Q80W22 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thnsl2Q80W22 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thnsl2Q80W22 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thnsl2Q80W22 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thnsl2Q80W22 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thnsl2Q80W22 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thnsl2Q80W22 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thnsl2Q80W22 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thnsl2Q80W22 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thnsl2Q80W22 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thnsl2Q80W22 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms