Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pnma8aQ80VM8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pnma8aQ80VM8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pnma8aQ80VM8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pnma8aQ80VM8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pnma8aQ80VM8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pnma8aQ80VM8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pnma8aQ80VM8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pnma8aQ80VM8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pnma8aQ80VM8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pnma8aQ80VM8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pnma8aQ80VM8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pnma8aQ80VM8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pnma8aQ80VM8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pnma8aQ80VM8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pnma8aQ80VM8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pnma8aQ80VM8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pnma8aQ80VM8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pnma8aQ80VM8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pnma8aQ80VM8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pnma8aQ80VM8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pnma8aQ80VM8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pnma8aQ80VM8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pnma8aQ80VM8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pnma8aQ80VM8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pnma8aQ80VM8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pnma8aQ80VM8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pnma8aQ80VM8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pnma8aQ80VM8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pnma8aQ80VM8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pnma8aQ80VM8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pnma8aQ80VM8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pnma8aQ80VM8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pnma8aQ80VM8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pnma8aQ80VM8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pnma8aQ80VM8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pnma8aQ80VM8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pnma8aQ80VM8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pnma8aQ80VM8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pnma8aQ80VM8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pnma8aQ80VM8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pnma8aQ80VM8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pnma8aQ80VM8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pnma8aQ80VM8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pnma8aQ80VM8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pnma8aQ80VM8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pnma8aQ80VM8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pnma8aQ80VM8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pnma8aQ80VM8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pnma8aQ80VM8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pnma8aQ80VM8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pnma8aQ80VM8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pnma8aQ80VM8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pnma8aQ80VM8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pnma8aQ80VM8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pnma8aQ80VM8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pnma8aQ80VM8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pnma8aQ80VM8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pnma8aQ80VM8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pnma8aQ80VM8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnma8aQ80VM8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnma8aQ80VM8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnma8aQ80VM8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnma8aQ80VM8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pnma8aQ80VM8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pnma8aQ80VM8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pnma8aQ80VM8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pnma8aQ80VM8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnma8aQ80VM8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnma8aQ80VM8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnma8aQ80VM8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnma8aQ80VM8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnma8aQ80VM8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnma8aQ80VM8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnma8aQ80VM8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnma8aQ80VM8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pnma8aQ80VM8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pnma8aQ80VM8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnma8aQ80VM8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnma8aQ80VM8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnma8aQ80VM8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnma8aQ80VM8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnma8aQ80VM8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnma8aQ80VM8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnma8aQ80VM8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnma8aQ80VM8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnma8aQ80VM8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnma8aQ80VM8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnma8aQ80VM8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pnma8aQ80VM8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pnma8aQ80VM8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pnma8aQ80VM8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pnma8aQ80VM8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pnma8aQ80VM8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pnma8aQ80VM8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pnma8aQ80VM8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pnma8aQ80VM8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pnma8aQ80VM8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pnma8aQ80VM8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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