Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ttll4Q80UG8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ttll4Q80UG8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Ttll4Q80UG8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Ttll4Q80UG8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ttll4Q80UG8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ttll4Q80UG8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ttll4Q80UG8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ttll4Q80UG8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ttll4Q80UG8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ttll4Q80UG8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ttll4Q80UG8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttll4Q80UG8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttll4Q80UG8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttll4Q80UG8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttll4Q80UG8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttll4Q80UG8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttll4Q80UG8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttll4Q80UG8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttll4Q80UG8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttll4Q80UG8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttll4Q80UG8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttll4Q80UG8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttll4Q80UG8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttll4Q80UG8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttll4Q80UG8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttll4Q80UG8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttll4Q80UG8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttll4Q80UG8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttll4Q80UG8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ttll4Q80UG8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ttll4Q80UG8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ttll4Q80UG8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttll4Q80UG8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttll4Q80UG8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttll4Q80UG8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttll4Q80UG8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttll4Q80UG8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttll4Q80UG8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttll4Q80UG8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttll4Q80UG8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttll4Q80UG8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttll4Q80UG8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttll4Q80UG8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttll4Q80UG8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttll4Q80UG8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttll4Q80UG8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttll4Q80UG8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttll4Q80UG8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttll4Q80UG8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttll4Q80UG8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttll4Q80UG8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttll4Q80UG8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttll4Q80UG8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttll4Q80UG8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttll4Q80UG8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttll4Q80UG8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttll4Q80UG8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttll4Q80UG8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ttll4Q80UG8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ttll4Q80UG8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttll4Q80UG8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttll4Q80UG8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttll4Q80UG8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttll4Q80UG8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttll4Q80UG8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttll4Q80UG8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttll4Q80UG8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttll4Q80UG8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ttll4Q80UG8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ttll4Q80UG8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttll4Q80UG8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttll4Q80UG8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttll4Q80UG8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ttll4Q80UG8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ttll4Q80UG8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ttll4Q80UG8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ttll4Q80UG8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ttll4Q80UG8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ttll4Q80UG8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ttll4Q80UG8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ttll4Q80UG8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ttll4Q80UG8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttll4Q80UG8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttll4Q80UG8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttll4Q80UG8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttll4Q80UG8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttll4Q80UG8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttll4Q80UG8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttll4Q80UG8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ttll4Q80UG8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ttll4Q80UG8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ttll4Q80UG8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Ttll4Q80UG8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttll4Q80UG8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ttll4Q80UG8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ttll4Q80UG8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ttll4Q80UG8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ttll4Q80UG8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ttll4Q80UG8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms