Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnphQ80U23 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnphQ80U23 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SnphQ80U23 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SnphQ80U23 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SnphQ80U23 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnphQ80U23 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnphQ80U23 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SnphQ80U23 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SnphQ80U23 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SnphQ80U23 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SnphQ80U23 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SnphQ80U23 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SnphQ80U23 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SnphQ80U23 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SnphQ80U23 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SnphQ80U23 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SnphQ80U23 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SnphQ80U23 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SnphQ80U23 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SnphQ80U23 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SnphQ80U23 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SnphQ80U23 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SnphQ80U23 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SnphQ80U23 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SnphQ80U23 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SnphQ80U23 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnphQ80U23 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SnphQ80U23 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SnphQ80U23 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SnphQ80U23 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SnphQ80U23 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SnphQ80U23 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SnphQ80U23 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SnphQ80U23 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SnphQ80U23 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SnphQ80U23 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SnphQ80U23 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SnphQ80U23 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SnphQ80U23 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SnphQ80U23 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SnphQ80U23 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SnphQ80U23 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SnphQ80U23 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SnphQ80U23 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SnphQ80U23 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SnphQ80U23 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SnphQ80U23 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SnphQ80U23 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SnphQ80U23 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SnphQ80U23 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SnphQ80U23 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SnphQ80U23 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SnphQ80U23 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SnphQ80U23 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SnphQ80U23 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SnphQ80U23 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SnphQ80U23 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SnphQ80U23 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SnphQ80U23 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SnphQ80U23 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SnphQ80U23 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SnphQ80U23 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SnphQ80U23 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SnphQ80U23 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SnphQ80U23 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SnphQ80U23 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SnphQ80U23 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SnphQ80U23 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SnphQ80U23 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SnphQ80U23 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnphQ80U23 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnphQ80U23 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnphQ80U23 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnphQ80U23 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SnphQ80U23 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SnphQ80U23 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SnphQ80U23 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SnphQ80U23 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SnphQ80U23 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SnphQ80U23 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SnphQ80U23 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SnphQ80U23 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SnphQ80U23 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SnphQ80U23 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SnphQ80U23 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SnphQ80U23 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SnphQ80U23 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SnphQ80U23 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SnphQ80U23 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SnphQ80U23 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SnphQ80U23 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SnphQ80U23 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SnphQ80U23 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SnphQ80U23 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SnphQ80U23 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SnphQ80U23 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SnphQ80U23 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SnphQ80U23 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SnphQ80U23 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms