Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Cul9Q80TT8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Cul9Q80TT8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Cul9Q80TT8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cul9Q80TT8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Cul9Q80TT8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cul9Q80TT8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cul9Q80TT8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Cul9Q80TT8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cul9Q80TT8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cul9Q80TT8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cul9Q80TT8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Cul9Q80TT8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cul9Q80TT8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Cul9Q80TT8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cul9Q80TT8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cul9Q80TT8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cul9Q80TT8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cul9Q80TT8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cul9Q80TT8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Cul9Q80TT8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Cul9Q80TT8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Cul9Q80TT8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Cul9Q80TT8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Cul9Q80TT8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cul9Q80TT8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Cul9Q80TT8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Cul9Q80TT8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Cul9Q80TT8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cul9Q80TT8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cul9Q80TT8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Cul9Q80TT8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cul9Q80TT8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cul9Q80TT8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cul9Q80TT8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cul9Q80TT8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cul9Q80TT8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cul9Q80TT8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cul9Q80TT8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Cul9Q80TT8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Cul9Q80TT8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Cul9Q80TT8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Cul9Q80TT8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cul9Q80TT8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cul9Q80TT8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cul9Q80TT8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cul9Q80TT8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cul9Q80TT8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cul9Q80TT8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Cul9Q80TT8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Cul9Q80TT8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cul9Q80TT8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cul9Q80TT8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cul9Q80TT8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cul9Q80TT8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cul9Q80TT8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cul9Q80TT8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cul9Q80TT8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cul9Q80TT8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cul9Q80TT8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cul9Q80TT8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Cul9Q80TT8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cul9Q80TT8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cul9Q80TT8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cul9Q80TT8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cul9Q80TT8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cul9Q80TT8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cul9Q80TT8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cul9Q80TT8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cul9Q80TT8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cul9Q80TT8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cul9Q80TT8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cul9Q80TT8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cul9Q80TT8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cul9Q80TT8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cul9Q80TT8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cul9Q80TT8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cul9Q80TT8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cul9Q80TT8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cul9Q80TT8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cul9Q80TT8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Cul9Q80TT8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cul9Q80TT8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cul9Q80TT8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cul9Q80TT8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cul9Q80TT8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cul9Q80TT8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cul9Q80TT8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cul9Q80TT8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cul9Q80TT8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Cul9Q80TT8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Cul9Q80TT8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Cul9Q80TT8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cul9Q80TT8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Cul9Q80TT8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Cul9Q80TT8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cul9Q80TT8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Cul9Q80TT8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Cul9Q80TT8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cul9Q80TT8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms