Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ube2q1Q7TSS2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ube2q1Q7TSS2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ube2q1Q7TSS2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ube2q1Q7TSS2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ube2q1Q7TSS2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ube2q1Q7TSS2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ube2q1Q7TSS2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ube2q1Q7TSS2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ube2q1Q7TSS2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ube2q1Q7TSS2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ube2q1Q7TSS2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ube2q1Q7TSS2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ube2q1Q7TSS2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ube2q1Q7TSS2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ube2q1Q7TSS2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ube2q1Q7TSS2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ube2q1Q7TSS2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ube2q1Q7TSS2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ube2q1Q7TSS2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ube2q1Q7TSS2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ube2q1Q7TSS2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ube2q1Q7TSS2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ube2q1Q7TSS2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ube2q1Q7TSS2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ube2q1Q7TSS2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ube2q1Q7TSS2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ube2q1Q7TSS2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ube2q1Q7TSS2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ube2q1Q7TSS2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ube2q1Q7TSS2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ube2q1Q7TSS2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ube2q1Q7TSS2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ube2q1Q7TSS2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ube2q1Q7TSS2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ube2q1Q7TSS2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ube2q1Q7TSS2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ube2q1Q7TSS2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ube2q1Q7TSS2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ube2q1Q7TSS2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ube2q1Q7TSS2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ube2q1Q7TSS2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ube2q1Q7TSS2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ube2q1Q7TSS2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ube2q1Q7TSS2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ube2q1Q7TSS2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ube2q1Q7TSS2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ube2q1Q7TSS2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ube2q1Q7TSS2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ube2q1Q7TSS2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ube2q1Q7TSS2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ube2q1Q7TSS2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ube2q1Q7TSS2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ube2q1Q7TSS2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ube2q1Q7TSS2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ube2q1Q7TSS2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ube2q1Q7TSS2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ube2q1Q7TSS2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ube2q1Q7TSS2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ube2q1Q7TSS2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ube2q1Q7TSS2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ube2q1Q7TSS2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ube2q1Q7TSS2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ube2q1Q7TSS2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ube2q1Q7TSS2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ube2q1Q7TSS2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ube2q1Q7TSS2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ube2q1Q7TSS2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube2q1Q7TSS2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube2q1Q7TSS2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube2q1Q7TSS2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ube2q1Q7TSS2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms