Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IfnkQ7TSL0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IfnkQ7TSL0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IfnkQ7TSL0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IfnkQ7TSL0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IfnkQ7TSL0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IfnkQ7TSL0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IfnkQ7TSL0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IfnkQ7TSL0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IfnkQ7TSL0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IfnkQ7TSL0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IfnkQ7TSL0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IfnkQ7TSL0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IfnkQ7TSL0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IfnkQ7TSL0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IfnkQ7TSL0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IfnkQ7TSL0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IfnkQ7TSL0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IfnkQ7TSL0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IfnkQ7TSL0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IfnkQ7TSL0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IfnkQ7TSL0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IfnkQ7TSL0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IfnkQ7TSL0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IfnkQ7TSL0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IfnkQ7TSL0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IfnkQ7TSL0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IfnkQ7TSL0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IfnkQ7TSL0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IfnkQ7TSL0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IfnkQ7TSL0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IfnkQ7TSL0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IfnkQ7TSL0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IfnkQ7TSL0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IfnkQ7TSL0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IfnkQ7TSL0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IfnkQ7TSL0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IfnkQ7TSL0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IfnkQ7TSL0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IfnkQ7TSL0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IfnkQ7TSL0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IfnkQ7TSL0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IfnkQ7TSL0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IfnkQ7TSL0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IfnkQ7TSL0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IfnkQ7TSL0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IfnkQ7TSL0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IfnkQ7TSL0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IfnkQ7TSL0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IfnkQ7TSL0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IfnkQ7TSL0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IfnkQ7TSL0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IfnkQ7TSL0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IfnkQ7TSL0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IfnkQ7TSL0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IfnkQ7TSL0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IfnkQ7TSL0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IfnkQ7TSL0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IfnkQ7TSL0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IfnkQ7TSL0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IfnkQ7TSL0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IfnkQ7TSL0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IfnkQ7TSL0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IfnkQ7TSL0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IfnkQ7TSL0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IfnkQ7TSL0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IfnkQ7TSL0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IfnkQ7TSL0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IfnkQ7TSL0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IfnkQ7TSL0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IfnkQ7TSL0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IfnkQ7TSL0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IfnkQ7TSL0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IfnkQ7TSL0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IfnkQ7TSL0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IfnkQ7TSL0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IfnkQ7TSL0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IfnkQ7TSL0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IfnkQ7TSL0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IfnkQ7TSL0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IfnkQ7TSL0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms