Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kcnf1Q7TSH7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kcnf1Q7TSH7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kcnf1Q7TSH7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kcnf1Q7TSH7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kcnf1Q7TSH7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kcnf1Q7TSH7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kcnf1Q7TSH7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kcnf1Q7TSH7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kcnf1Q7TSH7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcnf1Q7TSH7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kcnf1Q7TSH7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kcnf1Q7TSH7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kcnf1Q7TSH7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kcnf1Q7TSH7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kcnf1Q7TSH7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kcnf1Q7TSH7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kcnf1Q7TSH7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kcnf1Q7TSH7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Kcnf1Q7TSH7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kcnf1Q7TSH7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kcnf1Q7TSH7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kcnf1Q7TSH7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kcnf1Q7TSH7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kcnf1Q7TSH7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kcnf1Q7TSH7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kcnf1Q7TSH7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kcnf1Q7TSH7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kcnf1Q7TSH7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kcnf1Q7TSH7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kcnf1Q7TSH7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kcnf1Q7TSH7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kcnf1Q7TSH7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kcnf1Q7TSH7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kcnf1Q7TSH7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kcnf1Q7TSH7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kcnf1Q7TSH7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kcnf1Q7TSH7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kcnf1Q7TSH7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kcnf1Q7TSH7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kcnf1Q7TSH7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Kcnf1Q7TSH7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kcnf1Q7TSH7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Kcnf1Q7TSH7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kcnf1Q7TSH7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kcnf1Q7TSH7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kcnf1Q7TSH7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kcnf1Q7TSH7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kcnf1Q7TSH7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kcnf1Q7TSH7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kcnf1Q7TSH7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kcnf1Q7TSH7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kcnf1Q7TSH7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kcnf1Q7TSH7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kcnf1Q7TSH7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kcnf1Q7TSH7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kcnf1Q7TSH7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcnf1Q7TSH7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcnf1Q7TSH7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcnf1Q7TSH7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kcnf1Q7TSH7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Kcnf1Q7TSH7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kcnf1Q7TSH7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kcnf1Q7TSH7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kcnf1Q7TSH7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kcnf1Q7TSH7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kcnf1Q7TSH7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kcnf1Q7TSH7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kcnf1Q7TSH7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kcnf1Q7TSH7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcnf1Q7TSH7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcnf1Q7TSH7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcnf1Q7TSH7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcnf1Q7TSH7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcnf1Q7TSH7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Kcnf1Q7TSH7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kcnf1Q7TSH7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Kcnf1Q7TSH7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kcnf1Q7TSH7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kcnf1Q7TSH7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kcnf1Q7TSH7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kcnf1Q7TSH7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kcnf1Q7TSH7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kcnf1Q7TSH7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kcnf1Q7TSH7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kcnf1Q7TSH7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kcnf1Q7TSH7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kcnf1Q7TSH7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kcnf1Q7TSH7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kcnf1Q7TSH7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kcnf1Q7TSH7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kcnf1Q7TSH7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kcnf1Q7TSH7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kcnf1Q7TSH7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kcnf1Q7TSH7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kcnf1Q7TSH7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kcnf1Q7TSH7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Kcnf1Q7TSH7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kcnf1Q7TSH7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms