Protein–RNA interactions for Protein: Q794H2

Nap1l3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nap1l3Q794H2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nap1l3Q794H2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nap1l3Q794H2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nap1l3Q794H2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nap1l3Q794H2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nap1l3Q794H2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Nap1l3Q794H2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nap1l3Q794H2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nap1l3Q794H2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nap1l3Q794H2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nap1l3Q794H2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nap1l3Q794H2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nap1l3Q794H2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nap1l3Q794H2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nap1l3Q794H2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nap1l3Q794H2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nap1l3Q794H2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nap1l3Q794H2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nap1l3Q794H2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nap1l3Q794H2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nap1l3Q794H2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nap1l3Q794H2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nap1l3Q794H2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nap1l3Q794H2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nap1l3Q794H2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nap1l3Q794H2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nap1l3Q794H2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nap1l3Q794H2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Nap1l3Q794H2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nap1l3Q794H2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nap1l3Q794H2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nap1l3Q794H2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nap1l3Q794H2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nap1l3Q794H2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nap1l3Q794H2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nap1l3Q794H2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nap1l3Q794H2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nap1l3Q794H2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nap1l3Q794H2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nap1l3Q794H2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nap1l3Q794H2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nap1l3Q794H2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nap1l3Q794H2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nap1l3Q794H2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nap1l3Q794H2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nap1l3Q794H2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nap1l3Q794H2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nap1l3Q794H2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nap1l3Q794H2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nap1l3Q794H2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nap1l3Q794H2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nap1l3Q794H2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nap1l3Q794H2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nap1l3Q794H2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nap1l3Q794H2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nap1l3Q794H2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nap1l3Q794H2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nap1l3Q794H2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nap1l3Q794H2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nap1l3Q794H2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nap1l3Q794H2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nap1l3Q794H2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nap1l3Q794H2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nap1l3Q794H2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nap1l3Q794H2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Nap1l3Q794H2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nap1l3Q794H2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nap1l3Q794H2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nap1l3Q794H2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nap1l3Q794H2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nap1l3Q794H2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nap1l3Q794H2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nap1l3Q794H2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nap1l3Q794H2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nap1l3Q794H2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nap1l3Q794H2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nap1l3Q794H2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nap1l3Q794H2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nap1l3Q794H2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nap1l3Q794H2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nap1l3Q794H2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms