Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR4

Ppp2r2b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2bQ6ZWR4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp2r2bQ6ZWR4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ppp2r2bQ6ZWR4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppp2r2bQ6ZWR4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp2r2bQ6ZWR4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp2r2bQ6ZWR4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp2r2bQ6ZWR4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp2r2bQ6ZWR4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp2r2bQ6ZWR4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp2r2bQ6ZWR4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp2r2bQ6ZWR4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp2r2bQ6ZWR4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp2r2bQ6ZWR4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp2r2bQ6ZWR4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.2 ms