Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RfflQ6ZQM0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RfflQ6ZQM0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RfflQ6ZQM0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RfflQ6ZQM0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RfflQ6ZQM0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RfflQ6ZQM0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RfflQ6ZQM0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RfflQ6ZQM0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RfflQ6ZQM0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RfflQ6ZQM0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RfflQ6ZQM0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RfflQ6ZQM0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RfflQ6ZQM0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RfflQ6ZQM0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RfflQ6ZQM0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RfflQ6ZQM0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RfflQ6ZQM0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RfflQ6ZQM0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RfflQ6ZQM0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RfflQ6ZQM0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RfflQ6ZQM0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RfflQ6ZQM0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RfflQ6ZQM0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RfflQ6ZQM0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RfflQ6ZQM0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RfflQ6ZQM0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RfflQ6ZQM0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RfflQ6ZQM0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RfflQ6ZQM0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RfflQ6ZQM0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RfflQ6ZQM0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RfflQ6ZQM0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RfflQ6ZQM0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RfflQ6ZQM0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RfflQ6ZQM0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RfflQ6ZQM0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RfflQ6ZQM0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RfflQ6ZQM0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RfflQ6ZQM0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RfflQ6ZQM0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RfflQ6ZQM0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RfflQ6ZQM0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RfflQ6ZQM0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RfflQ6ZQM0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RfflQ6ZQM0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RfflQ6ZQM0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RfflQ6ZQM0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RfflQ6ZQM0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RfflQ6ZQM0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RfflQ6ZQM0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RfflQ6ZQM0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RfflQ6ZQM0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RfflQ6ZQM0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RfflQ6ZQM0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RfflQ6ZQM0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RfflQ6ZQM0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RfflQ6ZQM0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RfflQ6ZQM0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RfflQ6ZQM0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms