Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zc3h4Q6ZPZ3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zc3h4Q6ZPZ3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zc3h4Q6ZPZ3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zc3h4Q6ZPZ3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zc3h4Q6ZPZ3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zc3h4Q6ZPZ3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zc3h4Q6ZPZ3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zc3h4Q6ZPZ3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zc3h4Q6ZPZ3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zc3h4Q6ZPZ3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zc3h4Q6ZPZ3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zc3h4Q6ZPZ3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zc3h4Q6ZPZ3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zc3h4Q6ZPZ3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zc3h4Q6ZPZ3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zc3h4Q6ZPZ3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zc3h4Q6ZPZ3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zc3h4Q6ZPZ3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zc3h4Q6ZPZ3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zc3h4Q6ZPZ3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zc3h4Q6ZPZ3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zc3h4Q6ZPZ3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zc3h4Q6ZPZ3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zc3h4Q6ZPZ3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zc3h4Q6ZPZ3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zc3h4Q6ZPZ3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zc3h4Q6ZPZ3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Zc3h4Q6ZPZ3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zc3h4Q6ZPZ3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zc3h4Q6ZPZ3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zc3h4Q6ZPZ3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zc3h4Q6ZPZ3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zc3h4Q6ZPZ3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zc3h4Q6ZPZ3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zc3h4Q6ZPZ3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 368 ms