Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Asic3Q6X1Y6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Asic3Q6X1Y6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Asic3Q6X1Y6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Asic3Q6X1Y6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Asic3Q6X1Y6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Asic3Q6X1Y6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Asic3Q6X1Y6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Asic3Q6X1Y6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Asic3Q6X1Y6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Asic3Q6X1Y6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Asic3Q6X1Y6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Asic3Q6X1Y6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Asic3Q6X1Y6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Asic3Q6X1Y6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Asic3Q6X1Y6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Asic3Q6X1Y6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Asic3Q6X1Y6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Asic3Q6X1Y6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Asic3Q6X1Y6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Asic3Q6X1Y6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Asic3Q6X1Y6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26■■□□□ 1.75
Asic3Q6X1Y6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Asic3Q6X1Y6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Asic3Q6X1Y6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Asic3Q6X1Y6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Asic3Q6X1Y6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Asic3Q6X1Y6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Asic3Q6X1Y6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Asic3Q6X1Y6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Asic3Q6X1Y6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Asic3Q6X1Y6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Asic3Q6X1Y6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Asic3Q6X1Y6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Asic3Q6X1Y6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Asic3Q6X1Y6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Asic3Q6X1Y6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Asic3Q6X1Y6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Asic3Q6X1Y6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Asic3Q6X1Y6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Asic3Q6X1Y6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Asic3Q6X1Y6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Asic3Q6X1Y6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Asic3Q6X1Y6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Asic3Q6X1Y6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Asic3Q6X1Y6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Asic3Q6X1Y6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Asic3Q6X1Y6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Asic3Q6X1Y6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Asic3Q6X1Y6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Asic3Q6X1Y6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Asic3Q6X1Y6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Asic3Q6X1Y6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Asic3Q6X1Y6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Asic3Q6X1Y6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Asic3Q6X1Y6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Asic3Q6X1Y6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Asic3Q6X1Y6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Asic3Q6X1Y6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms