Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms