Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd300ld3Q6SJQ5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd300ld3Q6SJQ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd300ld3Q6SJQ5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms