Protein–RNA interactions for Protein: Q6RKD8

Flrt1, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flrt1Q6RKD8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Flrt1Q6RKD8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Flrt1Q6RKD8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Flrt1Q6RKD8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Flrt1Q6RKD8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Flrt1Q6RKD8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Flrt1Q6RKD8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Flrt1Q6RKD8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Flrt1Q6RKD8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Flrt1Q6RKD8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Flrt1Q6RKD8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Flrt1Q6RKD8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Flrt1Q6RKD8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Flrt1Q6RKD8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Flrt1Q6RKD8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Flrt1Q6RKD8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Flrt1Q6RKD8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Flrt1Q6RKD8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Flrt1Q6RKD8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Flrt1Q6RKD8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Flrt1Q6RKD8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Flrt1Q6RKD8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Flrt1Q6RKD8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Flrt1Q6RKD8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Flrt1Q6RKD8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Flrt1Q6RKD8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Flrt1Q6RKD8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Flrt1Q6RKD8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Flrt1Q6RKD8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Flrt1Q6RKD8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Flrt1Q6RKD8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Flrt1Q6RKD8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Flrt1Q6RKD8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Flrt1Q6RKD8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Flrt1Q6RKD8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Flrt1Q6RKD8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Flrt1Q6RKD8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Flrt1Q6RKD8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Flrt1Q6RKD8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Flrt1Q6RKD8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Flrt1Q6RKD8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Flrt1Q6RKD8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Flrt1Q6RKD8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Flrt1Q6RKD8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Flrt1Q6RKD8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Flrt1Q6RKD8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms