Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snx13Q6PHS6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snx13Q6PHS6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snx13Q6PHS6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snx13Q6PHS6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snx13Q6PHS6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snx13Q6PHS6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snx13Q6PHS6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snx13Q6PHS6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snx13Q6PHS6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snx13Q6PHS6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snx13Q6PHS6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snx13Q6PHS6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Snx13Q6PHS6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snx13Q6PHS6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snx13Q6PHS6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx13Q6PHS6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx13Q6PHS6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx13Q6PHS6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snx13Q6PHS6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snx13Q6PHS6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snx13Q6PHS6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snx13Q6PHS6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx13Q6PHS6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx13Q6PHS6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx13Q6PHS6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Snx13Q6PHS6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snx13Q6PHS6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snx13Q6PHS6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx13Q6PHS6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx13Q6PHS6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx13Q6PHS6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx13Q6PHS6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx13Q6PHS6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Snx13Q6PHS6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Snx13Q6PHS6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx13Q6PHS6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx13Q6PHS6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snx13Q6PHS6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snx13Q6PHS6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snx13Q6PHS6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snx13Q6PHS6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snx13Q6PHS6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snx13Q6PHS6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snx13Q6PHS6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snx13Q6PHS6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Snx13Q6PHS6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Snx13Q6PHS6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Snx13Q6PHS6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snx13Q6PHS6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snx13Q6PHS6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snx13Q6PHS6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snx13Q6PHS6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snx13Q6PHS6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snx13Q6PHS6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snx13Q6PHS6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snx13Q6PHS6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx13Q6PHS6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx13Q6PHS6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx13Q6PHS6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snx13Q6PHS6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snx13Q6PHS6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snx13Q6PHS6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snx13Q6PHS6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snx13Q6PHS6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Snx13Q6PHS6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snx13Q6PHS6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snx13Q6PHS6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snx13Q6PHS6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snx13Q6PHS6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snx13Q6PHS6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Snx13Q6PHS6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Snx13Q6PHS6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Snx13Q6PHS6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Snx13Q6PHS6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Snx13Q6PHS6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Snx13Q6PHS6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snx13Q6PHS6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snx13Q6PHS6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snx13Q6PHS6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snx13Q6PHS6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms