Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE7

Slc6a7, Sodium-dependent proline transporter, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a7Q6PGE7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc6a7Q6PGE7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Slc6a7Q6PGE7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc6a7Q6PGE7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc6a7Q6PGE7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc6a7Q6PGE7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc6a7Q6PGE7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc6a7Q6PGE7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc6a7Q6PGE7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc6a7Q6PGE7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc6a7Q6PGE7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc6a7Q6PGE7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc6a7Q6PGE7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc6a7Q6PGE7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a7Q6PGE7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a7Q6PGE7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a7Q6PGE7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a7Q6PGE7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc6a7Q6PGE7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc6a7Q6PGE7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc6a7Q6PGE7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc6a7Q6PGE7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc6a7Q6PGE7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc6a7Q6PGE7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc6a7Q6PGE7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc6a7Q6PGE7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc6a7Q6PGE7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc6a7Q6PGE7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc6a7Q6PGE7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc6a7Q6PGE7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc6a7Q6PGE7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc6a7Q6PGE7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc6a7Q6PGE7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc6a7Q6PGE7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc6a7Q6PGE7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc6a7Q6PGE7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc6a7Q6PGE7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc6a7Q6PGE7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc6a7Q6PGE7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc6a7Q6PGE7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc6a7Q6PGE7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc6a7Q6PGE7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms