Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vstm2lQ6PDS0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vstm2lQ6PDS0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vstm2lQ6PDS0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vstm2lQ6PDS0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vstm2lQ6PDS0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vstm2lQ6PDS0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vstm2lQ6PDS0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vstm2lQ6PDS0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vstm2lQ6PDS0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vstm2lQ6PDS0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vstm2lQ6PDS0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vstm2lQ6PDS0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vstm2lQ6PDS0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vstm2lQ6PDS0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vstm2lQ6PDS0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vstm2lQ6PDS0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vstm2lQ6PDS0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vstm2lQ6PDS0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vstm2lQ6PDS0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vstm2lQ6PDS0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vstm2lQ6PDS0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vstm2lQ6PDS0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm2lQ6PDS0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm2lQ6PDS0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm2lQ6PDS0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm2lQ6PDS0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm2lQ6PDS0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm2lQ6PDS0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm2lQ6PDS0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vstm2lQ6PDS0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vstm2lQ6PDS0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vstm2lQ6PDS0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vstm2lQ6PDS0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Vstm2lQ6PDS0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm2lQ6PDS0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm2lQ6PDS0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm2lQ6PDS0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm2lQ6PDS0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vstm2lQ6PDS0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vstm2lQ6PDS0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vstm2lQ6PDS0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vstm2lQ6PDS0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vstm2lQ6PDS0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vstm2lQ6PDS0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vstm2lQ6PDS0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vstm2lQ6PDS0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vstm2lQ6PDS0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vstm2lQ6PDS0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vstm2lQ6PDS0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vstm2lQ6PDS0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vstm2lQ6PDS0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vstm2lQ6PDS0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vstm2lQ6PDS0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vstm2lQ6PDS0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vstm2lQ6PDS0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vstm2lQ6PDS0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vstm2lQ6PDS0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vstm2lQ6PDS0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vstm2lQ6PDS0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vstm2lQ6PDS0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vstm2lQ6PDS0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vstm2lQ6PDS0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vstm2lQ6PDS0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vstm2lQ6PDS0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vstm2lQ6PDS0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vstm2lQ6PDS0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vstm2lQ6PDS0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vstm2lQ6PDS0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vstm2lQ6PDS0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vstm2lQ6PDS0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vstm2lQ6PDS0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vstm2lQ6PDS0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vstm2lQ6PDS0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms