Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc36Q6PDM4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc36Q6PDM4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc36Q6PDM4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc36Q6PDM4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc36Q6PDM4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc36Q6PDM4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc36Q6PDM4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc36Q6PDM4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc36Q6PDM4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc36Q6PDM4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc36Q6PDM4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc36Q6PDM4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc36Q6PDM4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc36Q6PDM4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc36Q6PDM4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc36Q6PDM4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc36Q6PDM4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc36Q6PDM4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc36Q6PDM4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc36Q6PDM4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc36Q6PDM4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc36Q6PDM4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc36Q6PDM4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc36Q6PDM4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc36Q6PDM4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc36Q6PDM4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc36Q6PDM4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc36Q6PDM4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc36Q6PDM4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc36Q6PDM4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc36Q6PDM4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc36Q6PDM4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 278.4 ms