Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
Gapvd1Q6PAR5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Gapvd1Q6PAR5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Gapvd1Q6PAR5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Gapvd1Q6PAR5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Gapvd1Q6PAR5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Gapvd1Q6PAR5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Gapvd1Q6PAR5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Gapvd1Q6PAR5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Gapvd1Q6PAR5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Gapvd1Q6PAR5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Gapvd1Q6PAR5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
Gapvd1Q6PAR5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Gapvd1Q6PAR5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Gapvd1Q6PAR5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Gapvd1Q6PAR5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Gapvd1Q6PAR5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Gapvd1Q6PAR5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Gapvd1Q6PAR5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Gapvd1Q6PAR5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Gapvd1Q6PAR5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Gapvd1Q6PAR5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Gapvd1Q6PAR5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Gapvd1Q6PAR5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Gapvd1Q6PAR5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Gapvd1Q6PAR5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Gapvd1Q6PAR5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Gapvd1Q6PAR5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
Gapvd1Q6PAR5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
Gapvd1Q6PAR5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Gapvd1Q6PAR5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
Gapvd1Q6PAR5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
Gapvd1Q6PAR5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Gapvd1Q6PAR5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
Gapvd1Q6PAR5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Gapvd1Q6PAR5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Gapvd1Q6PAR5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Gapvd1Q6PAR5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Gapvd1Q6PAR5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Gapvd1Q6PAR5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Gapvd1Q6PAR5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Gapvd1Q6PAR5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Gapvd1Q6PAR5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Gapvd1Q6PAR5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Gapvd1Q6PAR5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Gapvd1Q6PAR5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Gapvd1Q6PAR5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Gapvd1Q6PAR5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Gapvd1Q6PAR5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Gapvd1Q6PAR5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Gapvd1Q6PAR5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Gapvd1Q6PAR5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Gapvd1Q6PAR5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Gapvd1Q6PAR5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Gapvd1Q6PAR5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Gapvd1Q6PAR5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Gapvd1Q6PAR5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Gapvd1Q6PAR5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Gapvd1Q6PAR5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Gapvd1Q6PAR5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Gapvd1Q6PAR5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Gapvd1Q6PAR5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Gapvd1Q6PAR5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Gapvd1Q6PAR5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Gapvd1Q6PAR5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Gapvd1Q6PAR5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Gapvd1Q6PAR5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Gapvd1Q6PAR5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
Gapvd1Q6PAR5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Gapvd1Q6PAR5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Gapvd1Q6PAR5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Gapvd1Q6PAR5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Gapvd1Q6PAR5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Gapvd1Q6PAR5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Gapvd1Q6PAR5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Gapvd1Q6PAR5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Gapvd1Q6PAR5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Gapvd1Q6PAR5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
Gapvd1Q6PAR5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Gapvd1Q6PAR5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Gapvd1Q6PAR5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Gapvd1Q6PAR5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Gapvd1Q6PAR5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Gapvd1Q6PAR5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
Gapvd1Q6PAR5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Gapvd1Q6PAR5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Gapvd1Q6PAR5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Gapvd1Q6PAR5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Gapvd1Q6PAR5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Gapvd1Q6PAR5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
Gapvd1Q6PAR5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Gapvd1Q6PAR5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Gapvd1Q6PAR5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Gapvd1Q6PAR5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Gapvd1Q6PAR5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Gapvd1Q6PAR5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Gapvd1Q6PAR5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Gapvd1Q6PAR5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Gapvd1Q6PAR5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.4 ms