Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trak2Q6P9N8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trak2Q6P9N8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trak2Q6P9N8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trak2Q6P9N8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trak2Q6P9N8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trak2Q6P9N8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trak2Q6P9N8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trak2Q6P9N8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trak2Q6P9N8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trak2Q6P9N8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trak2Q6P9N8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Trak2Q6P9N8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trak2Q6P9N8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trak2Q6P9N8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trak2Q6P9N8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Trak2Q6P9N8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trak2Q6P9N8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trak2Q6P9N8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trak2Q6P9N8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trak2Q6P9N8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trak2Q6P9N8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trak2Q6P9N8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trak2Q6P9N8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Trak2Q6P9N8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trak2Q6P9N8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trak2Q6P9N8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trak2Q6P9N8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trak2Q6P9N8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trak2Q6P9N8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trak2Q6P9N8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trak2Q6P9N8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trak2Q6P9N8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trak2Q6P9N8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trak2Q6P9N8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trak2Q6P9N8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Trak2Q6P9N8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trak2Q6P9N8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trak2Q6P9N8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trak2Q6P9N8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trak2Q6P9N8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trak2Q6P9N8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trak2Q6P9N8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trak2Q6P9N8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trak2Q6P9N8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trak2Q6P9N8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trak2Q6P9N8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trak2Q6P9N8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trak2Q6P9N8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trak2Q6P9N8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trak2Q6P9N8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trak2Q6P9N8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trak2Q6P9N8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trak2Q6P9N8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trak2Q6P9N8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trak2Q6P9N8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trak2Q6P9N8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trak2Q6P9N8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trak2Q6P9N8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trak2Q6P9N8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trak2Q6P9N8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trak2Q6P9N8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trak2Q6P9N8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Trak2Q6P9N8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trak2Q6P9N8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trak2Q6P9N8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trak2Q6P9N8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trak2Q6P9N8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trak2Q6P9N8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trak2Q6P9N8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak2Q6P9N8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak2Q6P9N8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak2Q6P9N8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak2Q6P9N8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak2Q6P9N8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trak2Q6P9N8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trak2Q6P9N8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trak2Q6P9N8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trak2Q6P9N8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trak2Q6P9N8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Trak2Q6P9N8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trak2Q6P9N8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trak2Q6P9N8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trak2Q6P9N8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trak2Q6P9N8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trak2Q6P9N8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trak2Q6P9N8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trak2Q6P9N8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trak2Q6P9N8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trak2Q6P9N8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trak2Q6P9N8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trak2Q6P9N8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trak2Q6P9N8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trak2Q6P9N8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trak2Q6P9N8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trak2Q6P9N8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trak2Q6P9N8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trak2Q6P9N8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trak2Q6P9N8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trak2Q6P9N8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms