Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcf1Q6P542 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcf1Q6P542 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abcf1Q6P542 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abcf1Q6P542 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcf1Q6P542 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcf1Q6P542 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abcf1Q6P542 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abcf1Q6P542 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcf1Q6P542 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcf1Q6P542 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abcf1Q6P542 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abcf1Q6P542 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcf1Q6P542 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcf1Q6P542 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abcf1Q6P542 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abcf1Q6P542 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcf1Q6P542 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Abcf1Q6P542 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Abcf1Q6P542 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Abcf1Q6P542 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Abcf1Q6P542 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Abcf1Q6P542 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Abcf1Q6P542 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Abcf1Q6P542 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Abcf1Q6P542 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Abcf1Q6P542 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Abcf1Q6P542 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Abcf1Q6P542 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Abcf1Q6P542 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Abcf1Q6P542 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcf1Q6P542 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcf1Q6P542 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcf1Q6P542 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcf1Q6P542 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcf1Q6P542 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcf1Q6P542 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcf1Q6P542 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcf1Q6P542 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcf1Q6P542 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcf1Q6P542 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcf1Q6P542 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcf1Q6P542 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcf1Q6P542 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcf1Q6P542 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcf1Q6P542 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcf1Q6P542 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcf1Q6P542 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcf1Q6P542 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abcf1Q6P542 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abcf1Q6P542 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Abcf1Q6P542 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Abcf1Q6P542 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Abcf1Q6P542 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Abcf1Q6P542 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcf1Q6P542 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcf1Q6P542 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcf1Q6P542 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcf1Q6P542 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcf1Q6P542 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcf1Q6P542 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcf1Q6P542 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcf1Q6P542 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcf1Q6P542 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcf1Q6P542 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcf1Q6P542 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Abcf1Q6P542 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Abcf1Q6P542 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Abcf1Q6P542 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Abcf1Q6P542 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Abcf1Q6P542 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Abcf1Q6P542 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcf1Q6P542 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcf1Q6P542 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcf1Q6P542 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcf1Q6P542 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Abcf1Q6P542 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Abcf1Q6P542 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcf1Q6P542 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Abcf1Q6P542 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Abcf1Q6P542 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcf1Q6P542 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcf1Q6P542 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcf1Q6P542 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcf1Q6P542 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Abcf1Q6P542 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcf1Q6P542 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcf1Q6P542 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcf1Q6P542 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcf1Q6P542 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcf1Q6P542 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcf1Q6P542 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcf1Q6P542 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Abcf1Q6P542 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcf1Q6P542 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcf1Q6P542 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcf1Q6P542 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcf1Q6P542 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcf1Q6P542 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcf1Q6P542 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
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