Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1F6

Ppp2r2a, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2aQ6P1F6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp2r2aQ6P1F6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp2r2aQ6P1F6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp2r2aQ6P1F6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp2r2aQ6P1F6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp2r2aQ6P1F6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp2r2aQ6P1F6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp2r2aQ6P1F6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp2r2aQ6P1F6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp2r2aQ6P1F6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp2r2aQ6P1F6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp2r2aQ6P1F6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp2r2aQ6P1F6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp2r2aQ6P1F6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp2r2aQ6P1F6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp2r2aQ6P1F6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp2r2aQ6P1F6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp2r2aQ6P1F6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp2r2aQ6P1F6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp2r2aQ6P1F6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp2r2aQ6P1F6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp2r2aQ6P1F6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp2r2aQ6P1F6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp2r2aQ6P1F6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp2r2aQ6P1F6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp2r2aQ6P1F6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp2r2aQ6P1F6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp2r2aQ6P1F6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ppp2r2aQ6P1F6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp2r2aQ6P1F6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp2r2aQ6P1F6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp2r2aQ6P1F6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp2r2aQ6P1F6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp2r2aQ6P1F6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp2r2aQ6P1F6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp2r2aQ6P1F6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp2r2aQ6P1F6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp2r2aQ6P1F6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp2r2aQ6P1F6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp2r2aQ6P1F6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp2r2aQ6P1F6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp2r2aQ6P1F6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp2r2aQ6P1F6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp2r2aQ6P1F6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp2r2aQ6P1F6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp2r2aQ6P1F6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp2r2aQ6P1F6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp2r2aQ6P1F6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp2r2aQ6P1F6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp2r2aQ6P1F6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp2r2aQ6P1F6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp2r2aQ6P1F6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp2r2aQ6P1F6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp2r2aQ6P1F6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp2r2aQ6P1F6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp2r2aQ6P1F6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp2r2aQ6P1F6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp2r2aQ6P1F6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp2r2aQ6P1F6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp2r2aQ6P1F6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp2r2aQ6P1F6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp2r2aQ6P1F6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp2r2aQ6P1F6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp2r2aQ6P1F6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp2r2aQ6P1F6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp2r2aQ6P1F6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp2r2aQ6P1F6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp2r2aQ6P1F6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp2r2aQ6P1F6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp2r2aQ6P1F6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp2r2aQ6P1F6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp2r2aQ6P1F6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp2r2aQ6P1F6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp2r2aQ6P1F6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp2r2aQ6P1F6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp2r2aQ6P1F6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp2r2aQ6P1F6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp2r2aQ6P1F6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp2r2aQ6P1F6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp2r2aQ6P1F6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp2r2aQ6P1F6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp2r2aQ6P1F6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp2r2aQ6P1F6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp2r2aQ6P1F6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp2r2aQ6P1F6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp2r2aQ6P1F6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp2r2aQ6P1F6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp2r2aQ6P1F6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp2r2aQ6P1F6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp2r2aQ6P1F6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms