Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sec23ipQ6NZC7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sec23ipQ6NZC7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sec23ipQ6NZC7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Sec23ipQ6NZC7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sec23ipQ6NZC7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sec23ipQ6NZC7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sec23ipQ6NZC7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sec23ipQ6NZC7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sec23ipQ6NZC7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sec23ipQ6NZC7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sec23ipQ6NZC7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sec23ipQ6NZC7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sec23ipQ6NZC7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sec23ipQ6NZC7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sec23ipQ6NZC7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sec23ipQ6NZC7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sec23ipQ6NZC7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sec23ipQ6NZC7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sec23ipQ6NZC7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sec23ipQ6NZC7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sec23ipQ6NZC7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sec23ipQ6NZC7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sec23ipQ6NZC7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sec23ipQ6NZC7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sec23ipQ6NZC7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sec23ipQ6NZC7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sec23ipQ6NZC7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sec23ipQ6NZC7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Sec23ipQ6NZC7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sec23ipQ6NZC7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sec23ipQ6NZC7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sec23ipQ6NZC7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sec23ipQ6NZC7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sec23ipQ6NZC7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sec23ipQ6NZC7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sec23ipQ6NZC7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sec23ipQ6NZC7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sec23ipQ6NZC7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sec23ipQ6NZC7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sec23ipQ6NZC7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sec23ipQ6NZC7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sec23ipQ6NZC7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sec23ipQ6NZC7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sec23ipQ6NZC7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sec23ipQ6NZC7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sec23ipQ6NZC7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sec23ipQ6NZC7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sec23ipQ6NZC7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sec23ipQ6NZC7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sec23ipQ6NZC7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sec23ipQ6NZC7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sec23ipQ6NZC7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sec23ipQ6NZC7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sec23ipQ6NZC7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sec23ipQ6NZC7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sec23ipQ6NZC7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sec23ipQ6NZC7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sec23ipQ6NZC7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sec23ipQ6NZC7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sec23ipQ6NZC7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sec23ipQ6NZC7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sec23ipQ6NZC7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sec23ipQ6NZC7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sec23ipQ6NZC7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sec23ipQ6NZC7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sec23ipQ6NZC7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sec23ipQ6NZC7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sec23ipQ6NZC7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sec23ipQ6NZC7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sec23ipQ6NZC7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sec23ipQ6NZC7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sec23ipQ6NZC7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sec23ipQ6NZC7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sec23ipQ6NZC7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sec23ipQ6NZC7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sec23ipQ6NZC7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sec23ipQ6NZC7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms