Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CltbQ6IRU5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CltbQ6IRU5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltbQ6IRU5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltbQ6IRU5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltbQ6IRU5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltbQ6IRU5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltbQ6IRU5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltbQ6IRU5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltbQ6IRU5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltbQ6IRU5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltbQ6IRU5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltbQ6IRU5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltbQ6IRU5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltbQ6IRU5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltbQ6IRU5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltbQ6IRU5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltbQ6IRU5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltbQ6IRU5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltbQ6IRU5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltbQ6IRU5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltbQ6IRU5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltbQ6IRU5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltbQ6IRU5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltbQ6IRU5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltbQ6IRU5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltbQ6IRU5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltbQ6IRU5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltbQ6IRU5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltbQ6IRU5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltbQ6IRU5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CltbQ6IRU5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltbQ6IRU5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltbQ6IRU5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltbQ6IRU5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltbQ6IRU5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltbQ6IRU5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltbQ6IRU5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltbQ6IRU5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltbQ6IRU5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltbQ6IRU5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltbQ6IRU5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltbQ6IRU5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltbQ6IRU5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltbQ6IRU5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltbQ6IRU5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltbQ6IRU5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CltbQ6IRU5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CltbQ6IRU5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltbQ6IRU5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltbQ6IRU5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltbQ6IRU5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltbQ6IRU5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms