Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt42Q6IFX2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt42Q6IFX2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt42Q6IFX2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt42Q6IFX2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt42Q6IFX2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt42Q6IFX2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt42Q6IFX2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt42Q6IFX2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt42Q6IFX2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt42Q6IFX2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt42Q6IFX2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt42Q6IFX2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt42Q6IFX2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt42Q6IFX2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt42Q6IFX2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt42Q6IFX2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt42Q6IFX2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt42Q6IFX2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt42Q6IFX2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt42Q6IFX2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt42Q6IFX2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt42Q6IFX2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt42Q6IFX2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt42Q6IFX2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt42Q6IFX2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt42Q6IFX2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt42Q6IFX2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt42Q6IFX2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt42Q6IFX2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt42Q6IFX2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt42Q6IFX2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt42Q6IFX2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt42Q6IFX2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt42Q6IFX2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt42Q6IFX2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt42Q6IFX2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt42Q6IFX2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt42Q6IFX2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt42Q6IFX2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt42Q6IFX2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt42Q6IFX2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt42Q6IFX2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt42Q6IFX2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt42Q6IFX2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt42Q6IFX2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt42Q6IFX2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt42Q6IFX2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt42Q6IFX2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt42Q6IFX2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt42Q6IFX2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt42Q6IFX2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt42Q6IFX2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt42Q6IFX2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt42Q6IFX2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt42Q6IFX2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt42Q6IFX2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt42Q6IFX2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt42Q6IFX2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt42Q6IFX2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt42Q6IFX2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt42Q6IFX2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt42Q6IFX2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt42Q6IFX2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt42Q6IFX2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt42Q6IFX2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt42Q6IFX2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt42Q6IFX2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt42Q6IFX2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt42Q6IFX2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt42Q6IFX2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt42Q6IFX2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt42Q6IFX2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt42Q6IFX2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt42Q6IFX2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt42Q6IFX2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt42Q6IFX2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt42Q6IFX2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt42Q6IFX2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt42Q6IFX2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt42Q6IFX2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 968.5 ms