Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fndc3c1Q6DFV6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fndc3c1Q6DFV6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fndc3c1Q6DFV6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fndc3c1Q6DFV6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fndc3c1Q6DFV6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fndc3c1Q6DFV6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fndc3c1Q6DFV6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fndc3c1Q6DFV6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fndc3c1Q6DFV6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fndc3c1Q6DFV6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fndc3c1Q6DFV6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fndc3c1Q6DFV6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fndc3c1Q6DFV6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fndc3c1Q6DFV6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fndc3c1Q6DFV6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fndc3c1Q6DFV6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fndc3c1Q6DFV6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fndc3c1Q6DFV6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fndc3c1Q6DFV6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Fndc3c1Q6DFV6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Fndc3c1Q6DFV6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fndc3c1Q6DFV6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fndc3c1Q6DFV6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Fndc3c1Q6DFV6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fndc3c1Q6DFV6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fndc3c1Q6DFV6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fndc3c1Q6DFV6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fndc3c1Q6DFV6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fndc3c1Q6DFV6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fndc3c1Q6DFV6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fndc3c1Q6DFV6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fndc3c1Q6DFV6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fndc3c1Q6DFV6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fndc3c1Q6DFV6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Fndc3c1Q6DFV6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fndc3c1Q6DFV6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fndc3c1Q6DFV6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fndc3c1Q6DFV6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fndc3c1Q6DFV6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fndc3c1Q6DFV6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fndc3c1Q6DFV6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fndc3c1Q6DFV6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fndc3c1Q6DFV6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fndc3c1Q6DFV6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fndc3c1Q6DFV6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fndc3c1Q6DFV6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fndc3c1Q6DFV6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fndc3c1Q6DFV6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Fndc3c1Q6DFV6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fndc3c1Q6DFV6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fndc3c1Q6DFV6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fndc3c1Q6DFV6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fndc3c1Q6DFV6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Fndc3c1Q6DFV6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fndc3c1Q6DFV6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fndc3c1Q6DFV6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fndc3c1Q6DFV6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fndc3c1Q6DFV6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fndc3c1Q6DFV6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fndc3c1Q6DFV6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fndc3c1Q6DFV6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fndc3c1Q6DFV6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fndc3c1Q6DFV6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fndc3c1Q6DFV6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fndc3c1Q6DFV6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fndc3c1Q6DFV6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fndc3c1Q6DFV6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fndc3c1Q6DFV6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fndc3c1Q6DFV6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fndc3c1Q6DFV6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fndc3c1Q6DFV6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fndc3c1Q6DFV6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fndc3c1Q6DFV6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fndc3c1Q6DFV6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fndc3c1Q6DFV6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fndc3c1Q6DFV6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fndc3c1Q6DFV6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fndc3c1Q6DFV6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fndc3c1Q6DFV6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fndc3c1Q6DFV6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fndc3c1Q6DFV6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fndc3c1Q6DFV6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms