Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Atg9aQ68FE2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Atg9aQ68FE2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Atg9aQ68FE2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Atg9aQ68FE2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Atg9aQ68FE2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Atg9aQ68FE2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Atg9aQ68FE2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Atg9aQ68FE2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Atg9aQ68FE2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Atg9aQ68FE2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Atg9aQ68FE2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Atg9aQ68FE2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Atg9aQ68FE2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Atg9aQ68FE2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Atg9aQ68FE2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Atg9aQ68FE2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Atg9aQ68FE2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Atg9aQ68FE2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Atg9aQ68FE2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Atg9aQ68FE2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Atg9aQ68FE2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Atg9aQ68FE2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Atg9aQ68FE2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Atg9aQ68FE2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Atg9aQ68FE2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Atg9aQ68FE2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Atg9aQ68FE2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atg9aQ68FE2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atg9aQ68FE2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Atg9aQ68FE2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Atg9aQ68FE2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atg9aQ68FE2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atg9aQ68FE2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atg9aQ68FE2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atg9aQ68FE2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atg9aQ68FE2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atg9aQ68FE2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atg9aQ68FE2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atg9aQ68FE2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atg9aQ68FE2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atg9aQ68FE2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atg9aQ68FE2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atg9aQ68FE2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atg9aQ68FE2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atg9aQ68FE2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atg9aQ68FE2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atg9aQ68FE2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atg9aQ68FE2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Atg9aQ68FE2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atg9aQ68FE2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atg9aQ68FE2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atg9aQ68FE2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atg9aQ68FE2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atg9aQ68FE2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atg9aQ68FE2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atg9aQ68FE2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atg9aQ68FE2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atg9aQ68FE2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atg9aQ68FE2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atg9aQ68FE2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atg9aQ68FE2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atg9aQ68FE2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atg9aQ68FE2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atg9aQ68FE2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atg9aQ68FE2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atg9aQ68FE2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atg9aQ68FE2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atg9aQ68FE2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atg9aQ68FE2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atg9aQ68FE2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Atg9aQ68FE2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atg9aQ68FE2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atg9aQ68FE2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atg9aQ68FE2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atg9aQ68FE2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atg9aQ68FE2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Atg9aQ68FE2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atg9aQ68FE2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atg9aQ68FE2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atg9aQ68FE2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atg9aQ68FE2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atg9aQ68FE2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atg9aQ68FE2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Atg9aQ68FE2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atg9aQ68FE2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atg9aQ68FE2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atg9aQ68FE2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atg9aQ68FE2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Atg9aQ68FE2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atg9aQ68FE2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atg9aQ68FE2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atg9aQ68FE2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atg9aQ68FE2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atg9aQ68FE2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atg9aQ68FE2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atg9aQ68FE2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atg9aQ68FE2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atg9aQ68FE2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Atg9aQ68FE2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms