Protein–RNA interactions for Protein: Q64704

Stx3, Syntaxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx3Q64704 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx3Q64704 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx3Q64704 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx3Q64704 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx3Q64704 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx3Q64704 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx3Q64704 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx3Q64704 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx3Q64704 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx3Q64704 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx3Q64704 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx3Q64704 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx3Q64704 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx3Q64704 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx3Q64704 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx3Q64704 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx3Q64704 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx3Q64704 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx3Q64704 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx3Q64704 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx3Q64704 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx3Q64704 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx3Q64704 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx3Q64704 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx3Q64704 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx3Q64704 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx3Q64704 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx3Q64704 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx3Q64704 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx3Q64704 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx3Q64704 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx3Q64704 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx3Q64704 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx3Q64704 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx3Q64704 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx3Q64704 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stx3Q64704 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx3Q64704 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx3Q64704 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx3Q64704 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx3Q64704 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx3Q64704 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx3Q64704 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx3Q64704 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx3Q64704 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx3Q64704 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx3Q64704 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx3Q64704 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx3Q64704 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx3Q64704 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx3Q64704 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx3Q64704 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx3Q64704 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx3Q64704 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx3Q64704 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stx3Q64704 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx3Q64704 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx3Q64704 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx3Q64704 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx3Q64704 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx3Q64704 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx3Q64704 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx3Q64704 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx3Q64704 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx3Q64704 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx3Q64704 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx3Q64704 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx3Q64704 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx3Q64704 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx3Q64704 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx3Q64704 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx3Q64704 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx3Q64704 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx3Q64704 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx3Q64704 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx3Q64704 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx3Q64704 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx3Q64704 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx3Q64704 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx3Q64704 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx3Q64704 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx3Q64704 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx3Q64704 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx3Q64704 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx3Q64704 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx3Q64704 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx3Q64704 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx3Q64704 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx3Q64704 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx3Q64704 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx3Q64704 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx3Q64704 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx3Q64704 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx3Q64704 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx3Q64704 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx3Q64704 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx3Q64704 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx3Q64704 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx3Q64704 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stx3Q64704 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms