Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2a3Q64518 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2a3Q64518 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2a3Q64518 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2a3Q64518 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2a3Q64518 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2a3Q64518 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2a3Q64518 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2a3Q64518 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2a3Q64518 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2a3Q64518 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2a3Q64518 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2a3Q64518 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2a3Q64518 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2a3Q64518 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2a3Q64518 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2a3Q64518 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2a3Q64518 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2a3Q64518 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2a3Q64518 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2a3Q64518 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2a3Q64518 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2a3Q64518 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2a3Q64518 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2a3Q64518 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2a3Q64518 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2a3Q64518 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2a3Q64518 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2a3Q64518 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2a3Q64518 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp2a3Q64518 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp2a3Q64518 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2a3Q64518 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2a3Q64518 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2a3Q64518 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2a3Q64518 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2a3Q64518 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2a3Q64518 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2a3Q64518 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2a3Q64518 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2a3Q64518 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2a3Q64518 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2a3Q64518 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2a3Q64518 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2a3Q64518 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2a3Q64518 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atp2a3Q64518 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2a3Q64518 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2a3Q64518 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2a3Q64518 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2a3Q64518 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2a3Q64518 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2a3Q64518 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2a3Q64518 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2a3Q64518 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2a3Q64518 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2a3Q64518 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2a3Q64518 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2a3Q64518 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2a3Q64518 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2a3Q64518 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2a3Q64518 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2a3Q64518 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2a3Q64518 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2a3Q64518 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2a3Q64518 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.7 ms