Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CochQ62507 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CochQ62507 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CochQ62507 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CochQ62507 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CochQ62507 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CochQ62507 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CochQ62507 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CochQ62507 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CochQ62507 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CochQ62507 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CochQ62507 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CochQ62507 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CochQ62507 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CochQ62507 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CochQ62507 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CochQ62507 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CochQ62507 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CochQ62507 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CochQ62507 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CochQ62507 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CochQ62507 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CochQ62507 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CochQ62507 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CochQ62507 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CochQ62507 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CochQ62507 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CochQ62507 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CochQ62507 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CochQ62507 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CochQ62507 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CochQ62507 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CochQ62507 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CochQ62507 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CochQ62507 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CochQ62507 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CochQ62507 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CochQ62507 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CochQ62507 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CochQ62507 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CochQ62507 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CochQ62507 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CochQ62507 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CochQ62507 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CochQ62507 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CochQ62507 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CochQ62507 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CochQ62507 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CochQ62507 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CochQ62507 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CochQ62507 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CochQ62507 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CochQ62507 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CochQ62507 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CochQ62507 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CochQ62507 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CochQ62507 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CochQ62507 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CochQ62507 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CochQ62507 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CochQ62507 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CochQ62507 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CochQ62507 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CochQ62507 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CochQ62507 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CochQ62507 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CochQ62507 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CochQ62507 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CochQ62507 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CochQ62507 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CochQ62507 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CochQ62507 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CochQ62507 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CochQ62507 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CochQ62507 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CochQ62507 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CochQ62507 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CochQ62507 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CochQ62507 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CochQ62507 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CochQ62507 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CochQ62507 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CochQ62507 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CochQ62507 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CochQ62507 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CochQ62507 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CochQ62507 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CochQ62507 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CochQ62507 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CochQ62507 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CochQ62507 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CochQ62507 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CochQ62507 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CochQ62507 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CochQ62507 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CochQ62507 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CochQ62507 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CochQ62507 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CochQ62507 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CochQ62507 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms