Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20854Q62461 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20854Q62461 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20854Q62461 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20854Q62461 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20854Q62461 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20854Q62461 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20854Q62461 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20854Q62461 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms