Protein–RNA interactions for Protein: Q62351

Tfrc, Transferrin receptor protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfrcQ62351 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TfrcQ62351 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TfrcQ62351 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TfrcQ62351 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TfrcQ62351 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TfrcQ62351 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TfrcQ62351 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TfrcQ62351 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TfrcQ62351 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TfrcQ62351 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TfrcQ62351 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TfrcQ62351 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TfrcQ62351 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TfrcQ62351 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TfrcQ62351 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TfrcQ62351 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TfrcQ62351 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TfrcQ62351 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TfrcQ62351 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TfrcQ62351 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TfrcQ62351 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TfrcQ62351 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TfrcQ62351 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TfrcQ62351 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TfrcQ62351 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TfrcQ62351 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TfrcQ62351 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TfrcQ62351 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TfrcQ62351 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TfrcQ62351 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TfrcQ62351 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TfrcQ62351 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TfrcQ62351 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TfrcQ62351 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TfrcQ62351 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TfrcQ62351 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TfrcQ62351 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TfrcQ62351 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TfrcQ62351 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TfrcQ62351 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TfrcQ62351 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TfrcQ62351 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TfrcQ62351 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TfrcQ62351 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TfrcQ62351 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TfrcQ62351 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TfrcQ62351 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TfrcQ62351 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TfrcQ62351 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TfrcQ62351 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TfrcQ62351 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TfrcQ62351 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TfrcQ62351 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TfrcQ62351 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TfrcQ62351 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TfrcQ62351 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TfrcQ62351 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TfrcQ62351 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TfrcQ62351 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TfrcQ62351 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TfrcQ62351 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TfrcQ62351 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TfrcQ62351 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TfrcQ62351 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TfrcQ62351 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TfrcQ62351 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TfrcQ62351 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TfrcQ62351 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TfrcQ62351 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TfrcQ62351 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TfrcQ62351 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TfrcQ62351 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TfrcQ62351 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TfrcQ62351 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TfrcQ62351 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TfrcQ62351 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TfrcQ62351 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TfrcQ62351 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TfrcQ62351 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TfrcQ62351 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TfrcQ62351 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TfrcQ62351 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TfrcQ62351 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TfrcQ62351 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TfrcQ62351 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TfrcQ62351 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TfrcQ62351 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TfrcQ62351 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TfrcQ62351 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TfrcQ62351 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TfrcQ62351 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TfrcQ62351 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TfrcQ62351 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TfrcQ62351 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TfrcQ62351 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TfrcQ62351 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TfrcQ62351 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TfrcQ62351 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TfrcQ62351 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TfrcQ62351 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms