Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Krt33bQ61897 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt33bQ61897 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt33bQ61897 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt33bQ61897 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt33bQ61897 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt33bQ61897 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt33bQ61897 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt33bQ61897 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt33bQ61897 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt33bQ61897 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt33bQ61897 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt33bQ61897 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt33bQ61897 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt33bQ61897 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt33bQ61897 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt33bQ61897 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt33bQ61897 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt33bQ61897 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt33bQ61897 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt33bQ61897 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt33bQ61897 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt33bQ61897 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt33bQ61897 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt33bQ61897 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms