Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnna2Q61301 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnna2Q61301 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnna2Q61301 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnna2Q61301 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctnna2Q61301 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctnna2Q61301 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctnna2Q61301 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctnna2Q61301 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctnna2Q61301 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctnna2Q61301 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctnna2Q61301 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnna2Q61301 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnna2Q61301 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctnna2Q61301 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctnna2Q61301 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctnna2Q61301 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctnna2Q61301 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctnna2Q61301 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctnna2Q61301 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctnna2Q61301 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctnna2Q61301 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctnna2Q61301 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctnna2Q61301 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctnna2Q61301 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctnna2Q61301 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctnna2Q61301 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctnna2Q61301 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctnna2Q61301 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctnna2Q61301 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctnna2Q61301 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctnna2Q61301 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctnna2Q61301 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctnna2Q61301 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctnna2Q61301 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctnna2Q61301 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnna2Q61301 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnna2Q61301 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ctnna2Q61301 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctnna2Q61301 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctnna2Q61301 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctnna2Q61301 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctnna2Q61301 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctnna2Q61301 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctnna2Q61301 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctnna2Q61301 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctnna2Q61301 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctnna2Q61301 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnna2Q61301 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnna2Q61301 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnna2Q61301 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnna2Q61301 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnna2Q61301 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnna2Q61301 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctnna2Q61301 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctnna2Q61301 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctnna2Q61301 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ctnna2Q61301 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctnna2Q61301 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctnna2Q61301 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctnna2Q61301 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctnna2Q61301 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnna2Q61301 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnna2Q61301 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctnna2Q61301 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctnna2Q61301 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctnna2Q61301 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctnna2Q61301 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctnna2Q61301 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctnna2Q61301 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctnna2Q61301 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnna2Q61301 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnna2Q61301 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctnna2Q61301 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctnna2Q61301 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctnna2Q61301 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctnna2Q61301 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctnna2Q61301 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnna2Q61301 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnna2Q61301 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnna2Q61301 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnna2Q61301 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctnna2Q61301 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctnna2Q61301 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnna2Q61301 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnna2Q61301 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnna2Q61301 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctnna2Q61301 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctnna2Q61301 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctnna2Q61301 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctnna2Q61301 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnna2Q61301 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnna2Q61301 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnna2Q61301 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnna2Q61301 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnna2Q61301 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnna2Q61301 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnna2Q61301 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ctnna2Q61301 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctnna2Q61301 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms