Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prdm1Q60636 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prdm1Q60636 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prdm1Q60636 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Prdm1Q60636 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prdm1Q60636 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prdm1Q60636 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prdm1Q60636 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prdm1Q60636 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prdm1Q60636 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Prdm1Q60636 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prdm1Q60636 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Prdm1Q60636 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prdm1Q60636 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prdm1Q60636 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prdm1Q60636 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prdm1Q60636 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prdm1Q60636 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prdm1Q60636 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prdm1Q60636 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prdm1Q60636 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prdm1Q60636 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prdm1Q60636 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prdm1Q60636 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prdm1Q60636 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prdm1Q60636 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prdm1Q60636 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prdm1Q60636 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prdm1Q60636 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prdm1Q60636 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prdm1Q60636 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prdm1Q60636 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prdm1Q60636 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prdm1Q60636 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm1Q60636 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm1Q60636 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prdm1Q60636 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prdm1Q60636 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prdm1Q60636 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prdm1Q60636 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prdm1Q60636 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prdm1Q60636 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prdm1Q60636 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prdm1Q60636 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prdm1Q60636 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prdm1Q60636 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prdm1Q60636 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prdm1Q60636 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Prdm1Q60636 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prdm1Q60636 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prdm1Q60636 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prdm1Q60636 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prdm1Q60636 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prdm1Q60636 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prdm1Q60636 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prdm1Q60636 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Prdm1Q60636 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prdm1Q60636 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm1Q60636 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm1Q60636 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prdm1Q60636 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm1Q60636 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prdm1Q60636 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Prdm1Q60636 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prdm1Q60636 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm1Q60636 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm1Q60636 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prdm1Q60636 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prdm1Q60636 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Prdm1Q60636 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prdm1Q60636 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prdm1Q60636 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prdm1Q60636 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Prdm1Q60636 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prdm1Q60636 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prdm1Q60636 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prdm1Q60636 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prdm1Q60636 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prdm1Q60636 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prdm1Q60636 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm1Q60636 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm1Q60636 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm1Q60636 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm1Q60636 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm1Q60636 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm1Q60636 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm1Q60636 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm1Q60636 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm1Q60636 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm1Q60636 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm1Q60636 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm1Q60636 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm1Q60636 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm1Q60636 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm1Q60636 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm1Q60636 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm1Q60636 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm1Q60636 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm1Q60636 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Prdm1Q60636 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms