Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CttnQ60598 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CttnQ60598 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CttnQ60598 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CttnQ60598 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CttnQ60598 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CttnQ60598 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CttnQ60598 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CttnQ60598 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CttnQ60598 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CttnQ60598 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CttnQ60598 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CttnQ60598 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CttnQ60598 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CttnQ60598 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CttnQ60598 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CttnQ60598 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CttnQ60598 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CttnQ60598 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CttnQ60598 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CttnQ60598 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CttnQ60598 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CttnQ60598 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CttnQ60598 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CttnQ60598 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CttnQ60598 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CttnQ60598 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CttnQ60598 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CttnQ60598 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CttnQ60598 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CttnQ60598 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CttnQ60598 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CttnQ60598 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CttnQ60598 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CttnQ60598 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CttnQ60598 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CttnQ60598 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CttnQ60598 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CttnQ60598 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CttnQ60598 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CttnQ60598 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CttnQ60598 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CttnQ60598 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CttnQ60598 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CttnQ60598 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CttnQ60598 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CttnQ60598 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CttnQ60598 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CttnQ60598 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CttnQ60598 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CttnQ60598 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CttnQ60598 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CttnQ60598 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CttnQ60598 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CttnQ60598 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CttnQ60598 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CttnQ60598 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CttnQ60598 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CttnQ60598 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CttnQ60598 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CttnQ60598 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CttnQ60598 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CttnQ60598 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CttnQ60598 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CttnQ60598 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CttnQ60598 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CttnQ60598 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CttnQ60598 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CttnQ60598 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CttnQ60598 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CttnQ60598 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CttnQ60598 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CttnQ60598 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CttnQ60598 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CttnQ60598 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CttnQ60598 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CttnQ60598 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CttnQ60598 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CttnQ60598 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CttnQ60598 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CttnQ60598 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms