Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE3

Ccdc92b, Coiled-coil domain-containing 92B, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92bQ5SUE3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc92bQ5SUE3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc92bQ5SUE3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc92bQ5SUE3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc92bQ5SUE3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc92bQ5SUE3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc92bQ5SUE3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc92bQ5SUE3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc92bQ5SUE3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc92bQ5SUE3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc92bQ5SUE3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc92bQ5SUE3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc92bQ5SUE3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc92bQ5SUE3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc92bQ5SUE3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc92bQ5SUE3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc92bQ5SUE3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc92bQ5SUE3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc92bQ5SUE3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc92bQ5SUE3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc92bQ5SUE3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc92bQ5SUE3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc92bQ5SUE3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc92bQ5SUE3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc92bQ5SUE3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc92bQ5SUE3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc92bQ5SUE3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc92bQ5SUE3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc92bQ5SUE3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc92bQ5SUE3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc92bQ5SUE3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc92bQ5SUE3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc92bQ5SUE3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc92bQ5SUE3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc92bQ5SUE3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc92bQ5SUE3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc92bQ5SUE3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc92bQ5SUE3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc92bQ5SUE3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc92bQ5SUE3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc92bQ5SUE3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc92bQ5SUE3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc92bQ5SUE3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc92bQ5SUE3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc92bQ5SUE3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc92bQ5SUE3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc92bQ5SUE3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc92bQ5SUE3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc92bQ5SUE3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc92bQ5SUE3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc92bQ5SUE3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc92bQ5SUE3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc92bQ5SUE3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc92bQ5SUE3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc92bQ5SUE3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc92bQ5SUE3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc92bQ5SUE3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc92bQ5SUE3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc92bQ5SUE3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc92bQ5SUE3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc92bQ5SUE3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc92bQ5SUE3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc92bQ5SUE3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc92bQ5SUE3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc92bQ5SUE3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc92bQ5SUE3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc92bQ5SUE3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc92bQ5SUE3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc92bQ5SUE3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc92bQ5SUE3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc92bQ5SUE3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc92bQ5SUE3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc92bQ5SUE3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc92bQ5SUE3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc92bQ5SUE3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc92bQ5SUE3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc92bQ5SUE3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc92bQ5SUE3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc92bQ5SUE3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms